不论急性或慢性马兜铃酸肾病，预防至关重要。需从以下几方面做好：摒弃陈旧观念 加强中药管理。中药临床应重视毒副作用，消除“中草药天然，无毒副作用”的观念，加强中草药马兜铃酸含量的检测。
安全使用中药 强化毒副反应监测。临床避免使用含有马兜铃酸的中草药，肾脏疾病患者应禁用。对服用偏方、秘方的患者应监测肾小管功能，若出现肾小管功能损害应立即停药。
及时停药，一旦诊断明确，应立即停止含马兜铃酸药物，并对症支持治疗，维持内环境稳定。积极改善内环境，纠正酸中毒和电解质紊乱，氮质血症严重者应尽早行血液净化治疗。连续性血液净化治疗能否清除血液中马兜铃酸尚无报道。
慢性马兜铃酸肾病常伴随严重肾小管功能障碍，易发生酸碱和电解质失衡。治疗上特别注意预防和纠正酸中毒、低钾血症和低钠血症，保持内环境稳定。促进肾脏恢复，对急性马兜铃酸肾病，治疗力求促进肾小管上皮细胞修复，防止向慢性病变发展。
中药如冬虫夏草能促进肾小管上皮细胞生长，但其改善预后的对照研究不足。金水宝、百令胶囊、至灵胶囊等虫夏制剂常用于临床。促红细胞生成素能抑制马兜铃酸诱导的上皮细胞凋亡，促进细胞生长，应早期使用，剂量视患者血色素和血压情况而定。
慢性肾功能不全治疗，目标在于抑制肾小管间质纤维化，延缓慢性肾功能衰竭发展。参照一般慢性肾功能衰竭非透析疗法。对终末肾衰竭患者，适时施行肾脏替代治疗或肾移植。此类患者接受透析或移植后数年，仍会罹患复发率和恶性程度较高的尿路移行上皮癌。国外学者建议在进行肾移植时，同时摘除双肾及输尿管。
国外学者对少数病例短期观察，发现肾上腺皮质激素可能对改善马兜铃酸肾病患者的肾功能有一定效果，但缺乏长期预后影响的评价。血管紧张素II拮抗剂能否延缓肾功能恶化，目前缺乏临床研究证据。
马兜铃酸肾病（Ari- stolochic acid nephropathy）又常称关木通中毒性肾病，是一类由关木通及相关的药物所造成的急性或慢性肾小管间质疾病。马兜铃酸肾病的确切发病机制仍不明确。现有研究表明，马兜铃酸主要损伤肾小管上皮细胞，但不同剂量马兜铃酸损伤肾小管、导致间质纤维化的机制并不相同。过量摄入马兜铃酸是马兜铃酸肾病的主要病因。不论急性或慢性马兜铃酸肾病，目前均无有效的治疗方法。因此，马兜铃酸肾病重在预防。