1）投资标的不同
一级债基是除固定预期收益类金融工具以外，参与一级市场新股投资；二级债基是除固定预期收益类金融工具以外，适当参与二级市场股票买卖，也参与一级市场新股投资。
2）投资范围不同
由于一级债基投资于纯债和新股，而二级债基，除了这些还可以投资二级精股，也就是说，二级债基的投资范围要比一级债基的投资范围大一些。
3）资产配置不同
一级债基是高预期收益债组合打新股；二级债基是高预期收益债组合打新股精选添预期收益；也就是说，一级债基是纯债和新股的组合；而二级债基是纯债、新股和精选个股的组合，资产配置不同。
4）风险特征不同
由于投资标的和产品组成特点的不同，二级债基的风险加大了；一般来说，一级债基是中低风险，而二级债基是中等风险。
一级债基是指投资一级市场的债券基金，以投资债券为主，不参与二级市场股票交易的债券型基金，一级债基收益低于二级债基，但风险也低于二级债基。
二级债券是指参与二级市场投资的债券型基金（二级市场就是指证券交易所），也可以参与一级市场投资，投资者可以在基金合同中查看基金是一级还是二级债基。