最大的问题在于时间，以及人们认为的成本收益比。
临床微生物的药敏需要经过培养，分纯，鉴定，药敏。以现在可以应用于临床的最先进的办法，这个过程至少需要48小时。而大多数医院，绝大多数，48小时是拿不到药敏的结果的。
免疫力在正常范围内的微生物感染，比如人们常常说的“感冒。”如果是病毒感染，病毒无法培养，抗生素对病毒也无效，此时抗生素就是一安慰剂。
如果是细菌感染，一般人就自己搞点儿抗生素吃吃算了，当然，现在抗生素管的严点儿了，随便搞点儿没有以前那么容易，但也还没有太难。真觉得严重了，顶多去门诊。
门诊说“我得给你做个鉴定药敏，后天你来培养结果出来了，我再根据药敏结果给你开药，”以目前的医患关系，只怕没有医生敢这么说吧。
总结：
如果免疫功能低下，住院病人，感染是个很麻烦的事情，可能基础疾病还不是太致命，一个感染可能很快要命。这个时候，作为主治医生等不起，抢救病人优先，留取标本同时，经验用药得先上上。否则，说不定精准的药敏结果还没出来，病人已经先挂掉了。
人类与微生物已经互相利用，互相斗争了许多年，只怕这相依相伴的关系还会一直持续下去。
以上内容参考：
还是时间问题吧。确定病菌的检查需要的时间较长，这样的精确检查48小时可能也出不来结果。一般为了治愈就选择常用的一种或几种抗生素。
抗生素是抑制或害死病菌的！长期服用抗生素，会令病菌产生抗药性的！当拥有抗药性的病菌繁殖后，抗生素便会失效的！因此抗生素不能长期服用。
抗生素(antibiotics)是由微生物(包括细菌、真菌、放线菌属)或高等动植物在生活过程中所产生的具有抗病原体或其它活性的一类次级代谢产物，能干扰其他生活细胞发育功能的化学物质。
现临床常用的抗生素有转基因工程菌，培养液液中提取物以及用化学方法合成或半合成的化合物。
抗生素主要是由细菌、霉菌或其他微生物产生的次级代谢产物或人工合成的类似物。20世纪90年代以后，科学家们将抗生素的范围扩大，统称为生物药物素。
主要用于治疗各种细菌感染或致病微生物感染类疾病，一般情况下对其宿主不会产生严重的副作用。
2011年10月18日，中国卫生部表示，在中国，患者抗生素的使用率达到70%，是欧美国家的两倍，但真正需要使用的不到20%。预防性使用抗生素是典型的滥用抗生素。
基本用途：
1、抗生素最主要用于医疗方面。
2、对抗在人或动物体内的致病菌等病原体，可治疗大多数细菌、立克次体、支原体、衣原体、螺旋体等微生物感染导致的疾病。
3、对于病毒、朊毒体等结构简单的病原体所引起的疾病没有效用。
4、除了抗细菌性的感染外，某些抗生素还具有抗肿瘤活性，用于肿瘤的化学治疗。
5、有些抗生素还具有免疫抑制作用。
6、抗生素除用于医疗，还应用于生物科学研究、农业、畜牧业和食品工业等方面。
7、在畜牧业和农业中非治疗用途的抗生素，称为抗生素生长促进剂。
参考资料来源：百度文库--抗炎药、抗生素、抗菌药
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