民办非企业单位注销时，
注册资金是可以取出来的：
1、在清偿完所有债务（包括员工工资，物业费用等）后可以返回在帐的剩余资金。
2、注册资金必须在公司注销前取出来并销户。
民办非企业单位的个人投入资金处理:
民办非企业单位的个人投入资金要具体内容具体处理，一般来讲由于是非企业，不做
实收资本处理，作为借款处理。剩余财产按有关法律、法规和《章程》规定处理。
民办非企业单位举办者对其投入的资产不再拥有
财产权和处置权。
剩余财产的处理，应当接受业务主管单位、登记管理机关和其他有关机关的监督。
民办非企业单位管理办法：
第
二十一条 民办非企业单位申请注销登记的,应当于办理注销登记前,在业务主管单位和其他有关机关的指导下,成立清算组织,按照清算程序完成清算工作。清算期间,民办非企业单位不得开展清算以外的活动。
剩余财产的处理,应当接受业务主管单位、登记管理机关和其他有关机关的监督。
第二十二条 民办非企业单位法定代表人或者负责人应当自完成清算之日起15日内,向登记管理机关办理注销登记。办理注销登记,应当提交注销登记
申请书、业务主管单位的审查文件、注销税务登记凭证和清算报告。
登记管理机关准予注销登记的,发给注销证明文件,收缴登记证书、印章和财务凭证,并将注销登记情况告知其业务主管单位、税务、公安、价格、质量技术监督、人民银行等部门。
民办非企业单位自核准注销之日起终止。