虹膜颜色会因为人种的不同而深浅不一，而在东方人一般均为深棕色，若有颜色异常必须怀疑是一些全身性的疾病；像恶性贫血、铜代谢等。
决定眼珠颜色的是虹膜组织里所含有色素的量。而虹膜就是角膜后面瞳孔外围的一层环状薄膜，而瞳孔正是这层薄膜中央的一个圆孔。在虹膜组织里，含有两种不同的棕色色素：
1．虹膜后面有一层排列得非常整齐的上皮细胞，这里的色素不仅颗粒大，颜色深，而且排列紧密，一丝一毫光线也不可能由此通过，这层色素细胞永远不变。
2．另一种色素颗粒细，颜色淡，分散在虹膜浅层及其表面，这种色素随著年龄的增长而增多，愈到年老愈丰富。而人在非常幼小的时候，虹膜前层没有色素，虹膜深处的浓密色素，经过很厚的前层组织透露出来，就变为黑色的了。人到中年以后，色素逐渐增加，虹膜的颜色也由黑转棕，到老年，你所看到的虹膜颜色，全是以后沉积在虹膜层的细碎色素。而虹膜后层又浓又密的色素，反而被这层细碎的色素所掩盖，看不见了，这种细碎的色素颜色很淡，所以老年人的虹膜就变为黄色了。
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