从优生学的角度，从有利于后代的健康考虑的。近亲结婚与遗传病的发生、延续有密切关系。谁的孩子像谁，说的是子代与亲代相似或雷同，这叫做遗传。遗传是由身体内的基因相同造成的。由于近亲结婚的夫妇所携带的相同基因比较多，有些遗传病，只有当父母都有共同的“致病基因”而且“相遇”时，后代才能发病。在一般的婚配关系中，这种“相遇”的机会很少。而近亲结婚的情况就不同了，这种相遇的机会明显增加，因为他们来自同一祖先，共同的基因比较多。父母和亲生子女之间，同胞兄弟姐妹之间有1／2的基因相同，祖孙之间，伯、叔、舅、姑、娘、姨与内外侄女、侄甥之间有1／4基因相同。堂兄弟姐妹、姑表、姨表兄弟姐妹之间有1／8基因是相同的；表叔、舅与侄女、甥女之间有1／16基因相同，其表堂兄妹之间有1／32基因相同。相同基因越多，致病基因相遇的机会就越多，那么遗传病发病率就越高。
据估计，在正常人身上每人都常有5－6种隐性遗传病基因。近亲婚配可以明显提高常染色体隐性遗传病的发病率。
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