昆明健康证办理网点全市有46个免费办理处，主要是各区、县的疫控中心及部分医院。
1、本级：昆明市疾病预防控制中心
2、五华区：五华区人民医院，位于昆明市五华区东风西路406号；沙朗社区卫生服务中心；虹山社区社区卫生服务中心；大普吉社区卫生服务中心
3、盘龙区：盘龙区人民医院，位于昆明市盘龙区园博路13号；盘龙区疾控中心；龙泉卫生院
4、西山区：西山区疾控中心，位于昆明市西山区兴隆小区14幢；福海社区卫生服务中心；前卫社区卫生服务中心；碧鸡舍社区卫生服务中心；海口社区卫生服务中心；团结社区卫生服务中心
5、官渡区：官渡区疾控中心，关上体检分中心，官渡体检分中心；金马体检分中心；六甲体检分中心
6、东川区：东川区疾控中心
7、呈贡区：呈贡区疾控中心
8、昆明市各区的疾控中心都可免费办理健康证。
市疾控中心按照云南省现行相关规定提示，公共场所、食品、药品等经营许可证复印件及本人从业单位证明（介绍信）各一份。并携带体检者本人二代身份证供扫描录入使用。从业人员请在健康证有效期到期前15天内办理新证，超过15天的不予受理。建议以团体为单位进行预约，以减少排队等候时间。
《预防性健康检查管理办法》
第十四条 卫生监督机构根据健康检查结果，对预防性健康检查合格者签发健康合格证明。对不合格者提出处理意见并监督执行。原始材料同时交受检单位或规定的存档单位存档。第十五条 卫生监督机构须按年度将管辖范围内的预防性健康检查情况统一汇总、分析并及时报送当地卫生行政部门和上级卫生监督机构。