1、销售范围不同
甲类otc（红色）只能在具有《药品经营许可证》配备执业药师或药师以上技术人员的社会药店，医疗机构药房零售的非处方药。甲类非处方药须在药店由执业药师或药师指导下购买和使用。
乙类otc（绿色）除了社会药店和医疗机构药房外，还可在经过批准的普通零售商业企业零售的非处方药。乙类处方非处方药安全性更高，无需医师或药师的指导就可以购买和使用。
2、安全性不同
凡具有《药品经营企业许可证》的单位（要求配备执业药师），可以经营处方药与非处方药（包括甲、乙两类），经省级药品监督管理部门或其授权的药品监督管理部门批准的其它商业企业只能零售乙类非处方药。这样，乙类非处方药除可在药店出售外，还可在超市、宾馆、百货商店等处销售。
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3、价格不同
甲类药品是临床必需、使用广泛、疗效好、同类药品中价格低的药品。乙类药品是指治疗选择使用,疗效好,同类药品中比甲类药品价格略高的药品。乙类比甲类更安全。消费者要正确使用非处方药，必须切记在使用前应仔细阅读使用说明书。
OTC的甲类要比乙类的的疗效确切，安全性大了，而且相同用途OTC的甲类要比乙类的价格便宜，医保药品目录中OTC的甲类要比乙类占的比重大。
参考资料：
/baike.baidu.com/item/%E7%94%B2%E7%B1%BBOTC"target="_blank">百度百科-甲类OTC
/baike.baidu.com/item/%E4%B9%99%E7%B1%BBOTC"target="_blank">百度百科-乙类OTC