跟踪审计的主要内容如下：
1、前期阶段：参与招投标文件的审核和工程合同签订的审核，避免以后发生合同的纠纷。出具相应的意见单。
2、工程实施阶段：参与隐蔽工程的收方签证、避免事后审计没法审核，及时解决工程中遇到与结算有关的分弃，参与工程施工期间工程材料价格的审核，并给业主方提出相应的意见单，给业主的签证提供参考的依据。
3、工程竣工阶段：协助业主方办理工程的结算，并提出相应的意见和建议。
跟踪审计是一种全新的审计方法，是指单位审计部门组织对建设项目实施过程的合法性、真实性、规范性进行跟踪审计监督，是有效地利用有限的资金和资源，用尽可能小的费用、用尽可能快的速度和优良的质量，建成预期的项目，使其实现预期的功能。