威海市发展和改革委员会设有多个职能科室，以及市重点项目管理办公室，负责组织和协调各项重要工作。以下是部分科室的主要职责：
1. 办公室（政工科与其合署）
负责委机关日常管理和后勤服务，包括文电、会务、财务、安全保密等工作，以及党群、人事、机构编制和离退休人员管理等。
2. 法规信息科
负责起草规范性文件，研究经济社会发展问题，进行政策建议，处理行政复议和行政应诉工作，以及组织新闻宣传和信息发布。
3. 国民经济综合科（发展规划科与其合署）
分析经济形势，提出总量平衡、结构调整建议，编制中长期发展规划，参与重大建设项目论证等。
4. 工业科
研究工业发展战略，编制规划，争取政策扶持，负责固定资产投资项目审核等工作。
5. 基础产业科
专注于交通运输发展，规划重大项目，争取资金支持，参与基础设施建设项目管理等。
6. 农村经济发展科
提出农村经济发展政策，协调农业和农村发展，编制规划，参与资源环境协调工作。
7. 固定资产投资科
监测投资状况，编制规划，协调财政投资和审批建设项目等。
8. 利用外资与境外投资科
分析外资利用情况，协调国际资本引进，编制规划和管理外资项目等。
9. 社会发展科
研究社会发展战略，协调社会事业发展政策，负责国民经济动员工作。
10. 重点项目管理科
负责全市重点项目规划和管理，监督项目进度和资金使用。
11. 高新技术产业科
拟订高技术产业发展政策，推动产业化和技术进步。
12. 经济体制改革科（县域经济科）
研究经济体制改革，推进县域经济发展和相关改革工作。
市重点项目管理办公室负责全市重点项目的整体管理和协调工作，涉及铁路建设和核电项目等。
威海市发展和改革委员会是市人民政府组成部门，是综合研究拟订经济和社会发展政策，进行总量平衡，指导总体经济体制改革的宏观调控部门。