一、所在省市不同
1、雄安新区：雄安新区位于中国河北省保定市境内。
2、深圳经济特区：深圳经济特区位于广东省。
二、设立的意义不同
1、雄安新区：疏解北京非首都功能集中承载地，作为推进京津冀协同发展的两项战略举措，规划建设北京城市副中心和河北雄安新区，将形成北京新的两翼，拓展京津冀区域发展新空间。
2、深圳经济特区：中国特色社会主义进入新时代，支持深圳高举新时代改革开放旗帜、建设中国特色社会主义先行示范区，有利于在更高起点、更高层次、更高目标上推进改革开放，形成全面深化改革、全面扩大开放新格局；有利于更好实施粤港澳大湾区战略，丰富“一国两制”事业发展新实践；有利于率先探索全面建设社会主义现代化强国新路径，为实现中华民族伟大复兴的中国梦提供有力支撑。
3、浦东新区：浦东开发的使命所在，是要谋求一个它在世界经济全球对话格局中的重要位置，也就是浦东要承担上海对外开放、搞活经济的一个重要角色。国际对话包括政治对话与经济对话。上海通过浦东开发会逐步赢得世界经济中心之一的资格。
三、地理位置特点不同
1、雄安新区：雄安新区规地处北京、天津、保定腹地，区位优势明显、交通便捷通畅、生态环境优良、资源环境承载能力较强。
2、深圳经济特区：深圳毗邻香港，交通便利，气候温和，风景优美，在利用外资发展经济方面，具有得天独厚的条件。
3、浦东新区：浦东新区位于上海市东部，因处黄浦江东而得名。东濒东海，南临杭州湾，西隔黄浦江与宝山、杨浦、虹口、黄浦、徐汇5区相邻，并与闵行、奉贤2区接壤。
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本回答被网友采纳雄安新区与深圳特区、浦东新区的区别：
雄安新区与深圳特区和浦东新区均承担着改革开放的历史使命。深圳特区的设立，主要是为了吸引外资和扩大对外开放；浦东新区的设立则是进一步扩大对外开放的力度，并着力推进金融发展。雄安新区在改革开放中的角色尽管尚未明确，但从其疏解非首都功能的定位来看，有助于缓解政治资源与经济资源的盘根交错，降低寻租的空间，减少纷杂的利益集团带来的改革阻力。从这个角度而言，雄安新区代表的是更为深层次的改革，也是难度相对更高的改革。这也与我国改革进入深水区的背景是一致的。同时，雄安新区还承担着探索新型城镇化及创新转型的使命。
雄安新区的资源禀赋与深圳特区及浦东新区存在显著区别。在区位优势上，深圳特区主要依赖于毗邻香港的地理优势，承接港台等地的产业转移和资本流入；而浦东新区则依赖于长三角的经济腹地以及交通枢纽的地理优势；雄安新区则主要凭借其临近首都的地理优势，主要依赖于政治资源的再分配。表现在资金来源上，深圳和浦东均更大程度上依赖于外资的流入，而雄安新区则主要依赖国内资金的再配置，吸收国内的富余储蓄和产能。
雄安新区是京津冀战略的点睛之笔，承担着打造国内第三增长极的使命。目前，长三角和珠三角都市圈是国内经济的两大增长极。深圳特区是珠三角都市圈的核心，通过其自身辐射作用极大地带动了珠三角的经济发展；而浦东新区则是长三角都市圈的核心，对于长三角的经济发展也具有极强的辐射能力。而作为国内三大都市圈之一的京津冀地区，整体发展极不均衡，北京对周边地区的辐射带动作用较弱。雄安新区的设立有助于实现区域资源的均衡配置，并发挥其自身的辐射带动作用，真正将京津冀都市圈打造成为中国经济增长的第三极。
雄安新区的意义：
设立雄安新区，是党中央深入推进京津冀协同发展作出的一项重大决策部署，对于集中疏解北京非首都功能，探索人口经济密集地区优化开发新模式，调整优化京津冀城市布局和空间结构，培育创新驱动发展新引擎，以促进北部地区的区域和经济发展，并弥合首都与周围的工业农村地区的经济差距。 具有重大现实意义和深远历史意义。