肛周脓肿手术的时间是与脓肿的大小、位置、深度、与周围组织的浸润状况等因素有关系。如果较表浅的脓肿手术时间可能几分钟就完成，位置较深的脓肿手术时间应视病情具体分析。
术后要坚持每次排便后坐浴，洗净肛门，保持肛门部清洁，对预防肛周感染有重要意义，可以在医院或者淘宝买一个肛肠康复包，里面有手持式卫洗丽帮助每次便后用水清洗，不仅能有效清除肛门皱褶内残留的粪便和病菌，保持肛门部清洁，还不会刺激到肛周的皮肤；无痛透气垫帮助悬空透气肛门，促进伤口愈合；肛部水疗器放到马桶上帮助坐姿完成熏蒸坐浴，保证时间，坐浴目的是促进肛门局部的血液循环，可起到消炎、止痛、清洁的作用。
如感肛门不适或灼热感，应立即行肛门坐浴并及时就医诊治。