保险公司指定的修理厂不都是4S店，也有可能是合同约定的自主选择修理厂。
根据相关规定：“因保险事故损坏的第三者财产，应当尽量修复，修理前被保险人应当会同保险人检验、协商确定修理项目、方式和费用。否则保险人有权重新核定或拒绝赔偿。”也就是说，保险公司、被保险人和相关第三人应当协商确定一个具备资质的修理厂对汽车进行修理。
协商不成，保险公司只有权重新核定或拒绝赔偿，无权单方面确定汽车修理厂，特别是当被保险人可以找到修理费比较低的汽车修理厂时，保险公司的这种指定汽车修理厂的行为显然损害了被保险人的利益，应当依法承担相应的法律责任。