普外科的技术优势显著，专业精深，医疗设备先进。科室开展无张力疝修补术、腹腔镜胆囊切除术、肝囊肿开窗术、结直肠癌手术等，提供规范的肿瘤根治术及综合治疗、乳腺癌保乳手术及淋巴活检、肛肠中西结合治疗及PPH手术、胃癌活检吸附丝裂霉术腹腔化疗等服务。无张力疝修补术、腹腔镜技术、乳腺癌保乳手术均处于齐齐哈尔市内先进水平。
乳腺科则在包乳手术综合治疗、微创活检、百万妇女乳腺普查工程等方面处于领先地位。乳腺癌早期检出率、乳癌保乳手术、保留肋间替神经乳癌根治术、缩乳术等均处于齐齐哈尔市先进水平。乳癌X线钼靶机、乳腺专用CR等先进设备为科室提供了有力支持。
麻醉科设备齐全，技术精湛，可以对危重病人进行有创动静脉监测，熟练开展胸外科手术、肺、食道、气管疾病及胸腔镜手术、脑外科手术、嗜铬细胞瘤切除术及肾移植手术等麻醉服务。科室在无痛人流术、无痛分娩、小儿外科手术麻醉、全凭静脉麻醉、心肺功能不全患者神经阻滞麻醉及控制性降压技术等方面经验丰富。对围术期危急情况的处理能力较强，曾成功抢救心脏外伤和心跳骤停患者。
骨科开放床位50张，提供40张床位，并有资深医生在显微外科、脊柱外科领域具有领先地位。骨科能够独立开展颈前路手术、颈后路单双开门椎管成形术、椎弓根钉系统技术等手术，对常见的骨与关节损伤采用国际通用的先进器械及技术进行治疗。科室在省科研新技术、市科技进步、成果奖等方面取得显著成果，全科医护人员以高尚的医德和严谨的医风，致力于实现“一切为了人民健康”的目标。
齐齐哈尔医学院附属第三医院是一所集医疗、教学、科研、预防保健为一体，在黑龙江省西部地区非常有影响力的国家首批三级甲等医院。医院始建于1928年，医院占地面积5.9万平方米，建筑面积4.7万平方米，医院临床和医技科室设有55个专业，拥有开放床位950张，专业技术人员1129人。