农村办的一卡通遗失这样补办，方法如下：
1、农户携带身份证原件去就近的乡镇农商银行网点补办新卡，并同时补办社保卡对账簿，以便查询补贴资金到账情况。
2、农户持新办社保卡到社保所进行社保卡变更登记。
3、社保所登记完成后，农户到所在乡、镇、街道财政所，办理录入惠农补贴“一卡通”系统，以便用新的卡号打卡发放。
一、农村一卡通的作用有：
1、个人社会保障相关信息记录，电子凭证和信息查询等。记录参保人员姓名，身份证号码，出生年月，性别，民族户籍所在地等基本信息。
2、查询本人养老，失业，医疗，工伤和生育保险缴纳情况，可持卡到医院就医，到药店买药，办理医疗失业，养老，工伤和生育等社保事务。
3、查询养老保险，医疗保险累计总额等信息，办理领取养老金等社保事务进行求职，失业登记甚至参加职业培训等，将具有一卡多用功能，例如，缴水电费，公交车，乘车刷卡和电子钱包功能。
二、一卡通账户变更情况及办理变更步骤
（一）户主死亡变更：原户主死亡，户主变更其亲属。变更步骤及应提供资料：
1、继承人先到村级开具变更书面证明，村级签字并加盖公章；
2、继承人携带户口本、身份证、死亡人员火化证明、继承人社保卡和原户主《农村土地承包经营权证》复印件到财政所办理变更；
3、财政所在办理变更后，要引导变更户到农业、民政、扶贫等部门进行变更登记留档。
（二）户主分户合户变更：户主因分户、合户或土地变更。变更步骤及应提供材料：
1、村级证明（因地亩变更要注明变更数量，户主签字同意）；
2、因分户、合户地亩变更的需先到乡镇农经（综）站登记，经农经（综）站主管人员签字盖章后持《农村土地承包经营权证》到财政所办理变更。
（三）社保卡遗失变更：农户持新办社保卡直接到财政所办理变更。
三、“一卡通”账户特殊情况办理步骤及流程
（一）农户因持有外地社保卡或者非农商行社保卡的，可以携带身份证原件去就近的乡镇农商银行网点办理一个银行卡，然后持农商银行银行卡到所在乡、镇、街道财政所，办理录入惠农补贴“一卡通”系统，以便用新的卡号打卡发放。
（二）针对高龄、残疾等行动不便的特殊办（换）卡人群（包含重病患者、未成年等），可电话当地农商银行网点提供预约、上门等高效便捷服务，也可由行政村（社区）出具证明，指定亲属监护人或代理人携带身份证件到银行网点代办社保卡或银行卡，最后到财政所办理录入惠农补贴“一卡通”系统，以便用新的卡号打卡发放。
（三）对于外出返回受限人员的，可由社保所或行政村收集身份证复印件，批量开卡，也可由行政村出具证明，指定代理人代办银行卡，但开卡后做“只进不出”控制，即该社保卡上面的资金照常进账，但代理人不能取款交易，只能由所有人到银行柜面申请解控取款。
法律依据
《中华人民共和国社会保险法》
第六十四条 社会保险基金包括基本养老保险基金、基本医疗保险基金、工伤保险基金、失业保险基金和生育保险基金。除基本医疗保险基金与生育保险基金合并建账及核算外，其他各项社会保险基金按照社会保险险种分别建账，分账核算。社会保险基金执行国家统一的会计制度。
社会保险基金专款专用，任何组织和个人不得侵占或者挪用。
基本养老保险基金逐步实行全国统筹,其他社会保险基金逐步实行省级统筹，具体时间、步骤由国务院规定。
第六十七条 社会保险基金预算、决算草案的编制、审核和批准，依照法律和国务院规定执行。
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