吉林省吉林中西医结合医院的特色专科丰富多样，涵盖了软伤科、心血管内科、神经外科、内分泌肾病科、骨伤科和风湿类风湿科等多个领域。
软伤科作为省重点专科，专攻疑难腰椎间盘突出症，运用“三步六法”手法复位治疗，并创新出多种中西医结合疗法，如推拿、介入溶解术、经皮切吸加溶酶疗法等，治疗效果显著，深受患者好评。
心血管内科是中医药管理局重点建设的专科，凭借中西医结合方法，注重长期康复，如采用中医个性化治疗充血性心力衰竭和心肌炎，以及根据患者情况制定的高血压治疗方案，表现出显著的综合诊疗特色。
神经外科作为重点专科，技术力量雄厚，擅长中西医结合治疗脑病，采用手术显微镜技术，以及针对不同病症的创新术式，如三叉神经血管减压术等，保障了高水准的手术效果。
内分泌、肾病科以副主任以上技术职称医生为主，结合中西医治疗肾脏疾病，尤其在糖尿病和肾病综合症方面成果显著，采用血磁疗法治疗糖尿病并发症。
骨伤科则以西医为主，中医为辅，引进前沿技术，形成中西医结合的专科特色。
风湿类风湿科则强调内外兼治，总结出“八位一体疗法”，在减少西药副作用和提高生活质量方面有明显优势。
体检中心作为现代化专业体检机构，提供全面的健康管理服务，运用先进的设备和资深的医疗队伍，为市民提供个性化健康管理方案。
吉林省吉林中西医结合医院（吉林市第三人民医院）位于吉林市临江门，长春路9号。医院是吉林省中西医结合医、教、研基地，是吉林省唯一的一所三级甲等中西医结合综合性医院。2003年12月被国家中医药管理局确定为国家级重点中西医结合医院建设单位。2004年12月率先在吉林市卫生系统推行了ISO-9001质量体系的实施，通过了评审认证，按照ISO9001质量体系的要求，实行科学化管理。2004年市政府将医院定为吉林市城区唯一的“光明扶贫”定点医院和“低视力矫治”定点医院。医院现为大连医科大学教学医院、长春中医药大学附属医院、北华大学第三临床学院。