审计项目管理涉及多个关键要素，包括组织、人员、成本、质量和责任。上文已详细讨论了组织和人员管理，接下来主要探讨成本、质量和责任的管理方法。
对于审计项目成本管理，审计机关在实施审计项目时，会计算项目所需的各种非人工费用总和，包括动态费用、分摊的固定费用以及调整费用。首先，审计机关的计划管理部门制定预算，经负责人审核和机关会议批准。项目经费一旦确定，审计组负责调配和使用，审计负责人需实时监控经费使用，并在必要时进行调整。审计结束后，审计组会公开结算费用，公布给被审计单位，并在年终对项目成本进行考核，实施节约奖励、超支不补的奖惩制度。
审计项目质量管理的核心在于满足党政领导和人民群众的需求。通过自上而下的管理策略，设定明确的质量目标和分解审计流程，制定具体的标准和管理方法。在审计过程中，严格按标准复核审计业务流程，对发现问题及时纠正，并实施分级负责的制度，确保质量管理责任到位。强化内部复核，如现场一级复核和专职人员对实施方案的审查，以提高审计质量的监督和保证。
对于审计项目后评估，主要关注项目的基本情况、执行规范性和审计成效，这三方面细化为多个评价指标。对审计人员，评估其问题发现能力、专业技能、工作表现、职责履行和廉政情况等。
为了强化责任追究，建立了审计项目执法过错历史责任追究制度，对审计人员的21种执法过错行为实施终身责任追究，包括纠正错误、警告、批评教育、书面检查、通报批评、经济处罚、职务调整，甚至涉及刑事责任。
审计项目是审计人员根据审计工作计划安排，在一定的条件下，围绕特定的审计对象，为达到既定的审计目标，所承担的具体审计任务。这里的审计项目，是指我国各级审计机关开展的，以传统人工审查、就地审计为主要工作方式的各类常规审计、专项审计调查、核查社会审计机构的审计报告、上级审计机关统一组织的由多个审计机关、派出机构或业务部门参加的审计项目等（以下简称审计项目）。不涉及网络审计项目和送达审计项目。