根据中华人民共和国道路交通安全法，对于未登记的三无摩托车被扣的情况，法律有明确的规定。未经公安机关交通管理部门登记的摩托车是不允许上路行驶的。一旦发现此类情况，交通管理部门有权采取扣留措施，以维护道路交通秩序。
被扣摩托车的车主需接受强制性的交通法规学习，并面临罚款。对于因无证驾驶或未按规定行驶导致的交通事故，处理方式取决于事故严重程度。若事故无人伤亡，属民事责任范畴，需要进行民事赔偿；若有人受伤，根据伤势轻重，轻伤者同样需承担民事赔偿，而重伤者可能面临刑事拘留，拘留期限不超过15天。在此过程中，刑事责任的追究可能最高导致三年有期徒刑，并需支付相应的民事赔偿。
驾驶员必须确保摩托车挂有机动车号牌，放置检验合格标志和保险标志，且随车携带机动车行驶证。任何一项缺失都可能导致罚款。对于扣留的摩托车，车主必须按照规定处理，否则将面临更为严厉的处罚。如需详细了解相关规定和处理流程，建议咨询当地的交通管理部门或法律专业人士，以确保自身权益和安全。