法律分析：1、由权利人持权利证书主动向登记部门申请注销登记2、登记部门依职权对该登记事项予以纠正，并注销该权利证书。
法律依据：《中华人民共和国民法典》 第二百六十一条 农民集体所有的不动产和动产，属于本集体成员集体所有。下列事项应当依照法定程序经本集体成员决定：
（一）土地承包方案以及将土地发包给本集体以外的组织或者个人承包；
（二）个别土地承包经营权人之间承包地的调整； （三）土地补偿费等费用的使用、分配办法；
（四）集体出资的企业的所有权变动等事项；
（五）法律规定的其他事项。
根据《土地管理法》、《土地管理法实施条例》等相关法律法规，如果农村土地承包当事人认为农村土地承包经营权证和登记簿记载错误的，农户们有权申请更正。如果真的存在土地确权错误的情况，当事人可以主动向土地登记主管部门申请注销登记，之后经审查通过后登记部门依职权对该登记事项予以纠正，并注销该权利证书。办理农村土地承包经营权变更申请应提交以下材料：(一)变更的书面请求;(二)已变更的农村土地承包合同或其它证明材料; (三)农村土地承包经营权证原件。 交完材料之后，乡(镇)人民政府农村经营管理部门受理变更申请，符合规定的，报请原发证机关办理变更手续，并在农村土地承包经营权证登记簿上记载。 另外，如果农村土地承包经营权证严重污损、毁坏、遗失的，承包方应向乡(镇)人民政府农村经营管理部门申请换发、补发。经乡(镇)人民政府农村经营管理部门审核后，报请原发证机关办理换发、补发手续。办理农村土地承包经营权证换发、补发手续，应以农村土地经营权证登记簿记载的内容为准。