在水浒传中孙二娘第1次出现是在十字坡用蒙汗药,想放倒武松,后来和武松一起前往二龙山入伙,之后又加入梁山,最后在征讨方腊的时候战死。
张青本来在金光寺浇菜园,后来杀了人到树林里做强盗,一次打劫的时候碰到了孙二娘的父亲,孙二娘的父亲是一位退休的老强盗,孙二娘的父亲感觉张青能处,于是将女儿许配给张青,两人成亲以后就搬到郊外,在十字坡建了一个黑店,在卖包子的同时劫财。
武松斗杀西门庆以后,去县衙投案自首,之后武松被刺配孟州。在走到十字坡的时候想要休息,于是进了孙二娘的黑店。武松进店以后感觉不对劲,于是提醒公人小心。但是押送的官差没有听,喝了孙二娘的茶水,被蒙汗药放倒。而武松假装喝下,假装晕倒。在孙二娘即将动手的时候,武松突然暴起和孙二娘打在一起,孙二娘当然不敌武松,菜园子张青及时出现,为武松赔礼道歉。在听到武松的名号以后,菜园子张青和武松结拜为兄弟。
武松后来被张都监陷害,为了复仇,武松血溅鸳鸯楼。武松之后前去投奔孙二娘,武松当时正被通缉,孙二娘就用家里的一身头陀套装打扮武松,武松从此有了行者的名号,几人之后一起前往二龙山投奔鲁智深。鲁智深也曾经遇到过孙二娘夫妇,去二龙山落草,也是孙二娘推荐的。后来梁山一伙壮大,二龙山的这一帮土匪也就此加入了梁山,孙二娘之后一直在梁山负责情报工作。后来梁山被招安以后,孙二娘也跟着部队整讨四周的反贼。最终在征讨方腊的时候,被杜微用飞刀打死。