公务员一级主任科员大于四级主任科员。在公务员职级并行中，主任科员序列从低到高依次是初级主任科员、四级主任科员、三级主任科员、二级主任科员、一级主任科员。
我国实行公务员职位分类制度。公务员职务分为领导职务和非领导职务。
领导职务层次分为:国家级正职、国家家副职、省部级正职、省部级副职、厅局级正职、厅局级副职、县处级正职、县处级副职、乡科级正职、乡科级副职。
非领导职务层次在厅局级以下设置。
分为十级:巡视员、副巡视员、调研员、副调研员、主任科员、副主任科员、科员、办事员。
这是以前的设置。
根据新近公布的公务员法修订草案。非领导职务被分为了四等十二级，分别为:一级巡视员、二级巡视员、一级调研员、二级调研员、三级调研员、四级调研员、一级主任科员、二级主任科员、三级主任科员、四级主任科员、一级科员、二级科员。
原来的正副科变成了一二三四级主任科员，大小依次排列。按照这个排序，四级主任科员介于原来的科员和副科之间，而一级主任科员毫无疑问是正科，所以，一级主任科员肯定大于四级主任科员。
综合管理类公务员职级对应的级别:
(一)一级巡视员:十三级至八级;
(二)二级巡视员:十五级至十级;
(三)一级调研员:十七级至十一级;
(四)二级调研员:十八级至十二级;
(五)三级调研员:十九级至十三级;
(六)四级调研员:二十级至十四级;
(七)一级主任科员:二十一级至十五级;
(八)二级主任科员:二十二级至十六级;
(九)三级主任科员:二十三级至十七级;
(十)四级主任科员:二十四级至十八级;
(十一)一级科员:二十六级至十八级;
(十二)二级科员:二十七级至十九级。