个人所得税退税审核不通过的原因有身份信息错误、提供的银行卡账号不是由职员个人的身份证号开户等，若是填报个人收入时数据错误，或者是审核人员有疑点的，此时会进一步要求其更改后再提交申请。
一、个人所得税退税审核不通过的原因是什么? 个人所得税退税审核不通过的原因主要有以下几个方面:
(1)退税申请者的身份信息不正确;
(2)提交的银行账户信息不正确或者无效，导致税款无法退还;
(3)退税申请者的申报数据存在错误或者疑点;
(4)税务机关审核时发现有需要向退税申请者进一步核实了解的情况，但退税申请者未提供联系方式或者提供的联系方式不正确，无法联系;
(5)税务机关核实有关年度汇算申报信息，退税申请者尚未确认或说明。
二、个人所得税退税流程是怎样的? 第一步:准备申报
安装个人所得税软件，打开软件后，先进行注册登录，进入年度汇算:首页【常用业务】—【综合所得年度汇算】;
1)进入申报界面后，填报方式有【使用已申报数据填写】 和【自行填写】两种选择。
2)为了方便申报，推荐大家选择【使用已申报数据填写】，税务机关已按一定规则预填了部分申报数据，大家只需确认即可。
3)选择【使用已申报数据填写】—【开始申报】后，系统提示【标准申报须知(使用已申报数据)】，点击“我已阅读并知晓”，开始年度汇算申报。
第二步:确认信息
需要对个人基础信息、汇缴地、已缴税额进行确认
第三步:填报数据
确认预填的收入和扣除信息无误，可直接点击【下一步】。
第四步:计算税款
数据系统将自动计算您本年度综合所得应补(退)税额
第五步:提交申报
确认结果后，点击【提交申报】即可。
第六步:退(补)税
如存在多预缴税款，可选择【申请退税】。
个人所得税申请提交之前，必须要确保自己上报的信息是准确的，否则可能会导致退税的申请并不能通过。由于审核后确定需要退税的，会将此部分资金退回到职员提供的银行账户之中，为了避免发生错误，应该确保此银行账户是用自己身份证开户的。