采收果实后1—2个月左右是花芽分化期，大樱桃花芽分化时期集中，分化过程也迅速。花芽分化的迟早，与品种、树龄、树势、果枝类型及各年的气候状况有关。一般是早熟品种比晚熟品种分化早，成龄树、弱树比幼树、旺树、停长早的枝条分化早。天旱年份比多雨年份分化早。
由于大樱桃花芽分化过程集中，分化过程迅速，所以，树体对营养条件要求较高。营养条件不良时，影响花芽的质量，导致坐果率下降。调查发现：夏秋季气温高、日照时间长、降水量少的年份，花芽分化质量高，次年开花结果情况好。相反，果实收获后遇到“冷夏”（温度低、日照短的持续天气）对花芽的分化和产量不利。
为了促进花芽分化，除了在花芽大量分化期（采收后）加强肥水管理外，还要在秋、春两季满足树体对肥水的需要，以保证花芽分化的后期营养。大樱桃易缺硼，在缺硼的情况下，花芽发育不良，会造成只开花不结实。因此，要增加硼肥的供应。
在营养不良的情况下，花芽的发育质量差，会出现雌蕊退化现象。发生退化的花芽，柱头极短，在花瓣脱落前，柱头已变黄、萎缩而不能坐果。