杭州三墩镇中心小学的荣誉累累，展示了其在教育领域的卓越表现。 学校积极参与国家教育部课题"区域性小学一体化德育创新研究"，凭借出色的研究成果，荣获课题研究先进集体的称号。
在安全方面，学校在2006年被评为年度平安示范校园，充分体现了其对校园安全的高度重视和有效管理。
在课程改革上，西湖区基础教育给予高度肯定，授予其西湖区基础教育课程改革先进集体的荣誉，表明学校在教学改革中的领先地位。
在艺术教育方面，浙江省首届雏鹰杯中小学生戏剧展上，学校摘得一等奖，展示了学生的艺术才华和学校的艺术教育水平。
杭州三墩镇中心小学作为浙江省示范小学，无疑在教育质量上树立了标杆。 学校在2002年度被西湖区教育系统评为最满意单位，彰显了其在服务师生和家长方面的优秀表现。
在体育方面，学校积极推动《国家体育锻炼标准实施办法》，被授予先进单位，强调了体育教育的重要性和学生的全面发展。
在档案管理上，学校被评为杭州市一级综合档案室，展现了其规范化的文档管理和信息处理能力。
在教学研究、体育活动、工会工作和读书活动等多个领域，西湖区教育系统均给予学校高度评价，如校本教研先进学校、体育先进集体、优秀工会集体、浙江省读书活动优秀集体奖等。
此外，学校还荣获杭州市读书教育活动市级团体优胜奖，证明了其在教育普及和阅读推广方面的优秀成绩。
在党建工作中，西湖区教育系统规范化党支部的称号，体现出学校对党建工作的重视和严谨的组织管理。
杭州三墩镇中心小学更是凭借其全面的教育理念和卓越的实践，赢得了西湖区教育系统文明单位、现代教育技术先进集体、品德学科素质赛团体金奖、基建维修工作先进集体和优秀图书馆等多方面的认可。