菜籽油脂肪酸组成比例接近人体需求，低芥酸菜籽油饱和脂肪酸含量低，油酸含量高，亚麻酸含量仅次于胡麻油。菜籽油富含甾醇，有助于降低胆固醇、预防心血管疾病和抗癌。其多酚含量高，具有天然抗氧化作用。此外，菜籽油还含有维生素E、类胡萝卜素以及硒、铁等微量元素。
然而，菜籽油中的芥酸可能对人类健康产生不利影响，可能导致动物肾胆固醇水平升高，长期摄入可能影响生长发育。过去中国市场上销售的菜籽油是“双高”（高芥酸、高硫苷）类型，但经过育种改良，现已实现“双低”（低芥酸、低硫苷）品质。因此，现代的菜籽油不再需要担心高芥酸问题。
在食用菜籽油时，应注意油脂的保质期，避免食用过期油脂。由于菜籽油具有一定“青气味”，不适合直接用于凉拌菜。此外，经过高温加热后的菜籽油应避免重复使用。
菜籽油的分类包括：压榨和浸出两种制油工艺，转基因和非转基因原料，以及根据芥酸含量分为一般菜籽油和低芥酸菜籽油。
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