樊哙和刘邦的关系一直很好。在刘邦当亭长的时候，樊哙是一个杀狗的屠夫。这个时候，两人的地位相当，来往密切。至今当地还流传着刘邦吃樊哙的狗肉不给钱，使得樊哙搬家躲避的故事，也留下了龟汁狗肉的由来。
在刘邦娶了吕雉后不久，樊哙也娶了吕雉的妹妹。这样，刘邦和樊哙就成为了连襟，亲上加亲。在战争中，樊哙作为刘邦的心腹，除了在战场上征战，在其他很多场合，都起到了别人起不到的作用。
在著名的鸿门宴中，项羽对是否杀死刘邦持犹豫态度。而项羽的手下范增是必杀刘邦而后快。因此，范增让项庄在宴席上舞剑，想要刺杀刘邦。在这种危急关头，是樊哙闯进营帐，打断了范增的阴谋。
由于樊哙的勇气，他得到了项羽的首肯。于是赐酒肉给他，樊哙趁机说出刘邦不曾背约，而因为小人中伤而杀刘邦，会让天下人寒心的道理。这样一来，使得项羽更加难以下手，最终放过了刘邦。可以说，没有樊哙的努力，刘邦在鸿门宴上是很难脱身的。因此，在《史记》里明确的就写道，是因为张良、樊哙，刘邦在鸿门宴得以无事。
但是，等到天下已定，一切都又发生了变化。虽然樊哙依然是刘邦的亲信，可是，他和刘邦的关系越来越疏远了。那至于最后，刘邦临死前下令，派陈平去处死樊哙。这又是为什么呢？
发生这一切的原因，就出在刘邦的身上。这是刘邦政治手腕的体现。由于刘邦的刻意经营，汉朝形成了朝臣、外戚和宦官三位一体的格局。
刘邦出身平民，持三尺剑取天下。可是，也是因为出身平民，他没有贵族世家的势力。在夺取天下的过程中，他的手下汇集了各方面的势力。这些势力集合在一起，成为足以左右政局的朝臣势力。
这些朝臣很多都是刘邦的发小，刘邦说自己是龙子那套只能骗骗别人，对他们不起作用。史书记载这些人在汉朝开国的时候，在朝堂上喝酒争功，拔剑击柱，根本就没有把刘邦放在眼里。他们认为，这个天下是自己和刘邦共同打下的，是共有的天下。
可是，刘邦既然当了天子，这个天下在刘邦心里，就是姓刘的。在他向父亲祝寿时说，看看我的功业和兄弟们的谁大？就明明白白的说明了刘邦的心思。
为了巩固自己的家天下，让自己刘家的天下能够传承下去，刘邦想尽了办法。就是从刘邦起，汉家的朝臣、外戚和宦官三驾马车的格局被刘邦开始确立起来。但是，这中间也有波折。
在这里，除了确定朝仪，建立皇家法度之外，刘邦首先是默认外戚势力的建立。吕后势力的建立，完全是出于刘邦的纵容默许。樊哙的妻子是吕后的妹妹，当然是吕后阵营中，重要的一员。
樊哙看到吕后受到刘邦的扶助，当然不会放过这个千载难逢的机会。他一头扎进吕后的怀抱，成为吕后的得力助手。他为了给吕后拉拢帮手，能够向和他平级的韩信跪接跪送，口称韩信大王，自称臣。可是他反到被韩信耻笑，这也是吕后杀不受拉拢的韩信的原因之一。
在最关键的时候，也是樊哙为吕后出马。在英布造反的时候，刘邦身体不好，想让太子出征。可是，吕后集团的人们认为，出兵讨伐英布，那些将领都是老将，除了刘邦，太子是驾驭不了他们的。因此，他们想让刘邦亲自出马。
刘邦因为身体不好独自住在宫中，谁都不见。十几天后，樊哙仗着自己连襟的身份，闯进了刘邦的寝宫。看到刘邦独自枕着一个宦官休息，樊哙流着眼泪，以赵高的教训来劝谏刘邦。刘邦才笑着起身，亲自带兵平定了英布的叛乱。
在这一段历史里，樊哙在吕后集团中，起到了举足轻重的作用。他先是打断了刘邦避见的策略，然后劝刘邦出马平叛，最后还打消了刘邦企图启用宦官的念头。这样一来，刘邦的计划破灭，只得笑而起身。可这笑里，已经有了杀心。
到刘邦临终前，已经对外戚势力的壮大有了戒心。刘邦扶植外戚势力，是为了保证刘氏江山的延续稳固，而不是为了把江山拱手送给外姓。所以，他在外戚和朝臣之间搞起了平衡。
他遗命任用曹参、陈平、王陵等人，却安下了最重要的一个人周勃。并且说，周勃少文，但是安刘氏者必定是周勃。
在刘邦临死前，刘邦突然发现自己对势力的评判出现了误差。他本来想这样安排，自己的宠妃戚夫人和赵王如意能够安全。但是，由于吕后的势力过于强大，政权已经失去了平衡。如果自己一死，吕后当权，戚夫人和赵王难逃一死。
因此，在有人密告樊哙要等刘邦死后，就杀掉戚夫人和赵王如意时，刘邦抓住机会，决定杀死樊哙，以削弱吕后的势力。可惜这个时候刘邦的身体已经病入膏肓了。接到指令的陈平害怕刘邦死后，自己会因为杀死樊哙遭到吕后的报复，放过了樊哙。
因此，刘邦要杀樊哙并不是听信了谗言，而是基于政治上的平衡做出的决定。但是，由于时间和身体的原因没有能够实现。在刘邦死后，在执掌军权的樊哙的帮助下，吕后执掌了政权。她诛杀戚夫人和赵王如意，给诸吕封王，指挥天下。但吕后最后还是落入刘邦的算计。在她死后，周勃灭了诸吕，最后安定了刘氏。
在此后的日子里，汉朝的皇帝对朝臣十分忌惮，甚至汉文帝都不敢去上任。直到汉武帝的时候，情况才改变了过来。汉武帝重用外戚，将权力重新收回到自己手中。可是，由于刘邦建国时的架构，汉朝的政权的权力就在朝臣、外戚的手中交替，最终由外戚王莽终结了西汉这个朝代。