原理上不一样，pcie通道直接连到处理器，sata总线先到南桥，这个体现在延时上。
速度不一样，sata3的ssd上限大概600MB，pcie x4的上限大概4GB。
接口不一样，虽然m2的看起来一样，但是实际上不一样，sata总线的m2一般都是两个缺口，pcie的一般只有一个缺口，而英特尔的750只能插在pcie插槽里面。
pcie总线的ssd很多不支持作为系统盘
目前sata3的固态硬盘已经接近理论上限，所以没什么余地了，pcie x4（注意是x4，以后可能有x8甚至x16），目前三星的sm961已经到了3GB的速度，而多数厂商还没到2GB，这个还有发展的余地。