不能。
化肥属于无机盐类，与菌肥混用，微生物周围盐浓度过高，会造成菌种生理性失水而死亡。另外，有些挥发性的化肥，氨气也会杀菌。
1、微生物菌肥，是现在在设施农业上常用的一种肥料。
优点：微生物菌肥可以改良土壤的微生物环境，增加土壤生物菌量，改善土壤中的一些固定的营养元素，促进农作物根部对养分的吸收。
缺点：微生物菌肥虽然也叫做肥，但是却并不具备任何营养元素，只是充分活化了土壤原本就含有的养分，所以无法长时间为作物提供养料。
2、化肥
优点：化肥养分含量比较高、肥效快、对作物的增产效果明显、投入成本也相对较低。
缺点：化肥缺点也比较明显，比如养分单一，容易挥发，利用率比较低，一旦使用方法不当就极易产生肥害。
扩展资料
土壤中有益微生物的数量越多，活跃性越高，对农作物的根系生长越有利。因为土壤中的有益微生物能分解和释放养分，促进腐殖质的形成，有利于对土壤中氮素的固定，有益微生物能直接参与土壤肥力的形成，但是在我们耕作的农田里，有益微生物的数量有，但是不多，因此应合理的人工补充。
微生物菌肥与其他肥料不同，微生物肥料对光敏感，如果长时间在太阳光底下直射，就会杀死其中的有益菌，如果与部分农药混合使用，也有可能降低减肥的效果。菌肥如果发挥最大的效果，在有机质丰富的土壤里菌肥更能发挥其肥效。
一般有机肥大多作为基施，有机肥富含有机质，是改良土壤和增加土壤肥力的物质之一。因为它的肥效长，肥效慢，要想有机肥达到预期的效果，在使用前必须经过充分的腐熟，如果在后期追施，效果不如复合肥明显。
微生物菌肥最好与有机肥同时使用，有机肥是微生物菌肥最好的搭配伙伴，和有机肥一起施入土壤后，经过大量的繁殖，可以起到以有益菌抑制有害菌的效果。
参考资料来源：百度百科-微生物菌肥
参考资料来源：百度百科-化肥
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