吉林大学校区专业分布：前卫校区、南岭校区、新民校区、朝阳校区、南湖校区、和平校区。
1.吉林大学前卫校区
吉林大学中心校区为原吉林大学新校区，分布的专业院系主要有人文学部(哲学社会学院、文学院、外国语学院、艺术学院、体育学院、公共外语教育学院)、社会科学学部(经济学院、法学院、行政学院、商学院、马克思主义学院、东北亚研究院、金融学院、公共外交学院)。
理学部(数学学院、物理学院、化学学院、生命科学学院)、信息科学学部(电子科学与工程学院、计算机科学与技术学院、软件学院、公共计算机教学与研究中心)等。
2.吉林大学南岭校区
吉大南岭为原吉林工大校区分布的院系和专业有：有机械设计及理论，材料加工，车辆工程，农业机械，并拥有机械工程一级学科国家重点学科。。
3.吉林大学新民校区
吉林大学新民校区为原白求恩医科大学，所以新民校区是以医学院为主。内还有学校设有白求恩医学院、基础医学院、公共卫生学院、护理学院、药学院五个学院，并有四所附属医院，一个制药厂。
4.吉林大学朝阳校区
吉林大学朝阳校区前身是长春地质学院，现在拥有地球科学学院，地球探测科学与技术学院，建设工程学院，仪器与电气工程学院，新能源与环境学院等。
5.吉林大学南湖校区
吉林大学南湖校区即现吉林大学通信工程学院所在地，2001年由原吉林工业大学信息科学与工程学院和原长春邮电学院相关专业整合组建，是我国信息与通信工程、控制科学与工程、仪器科学与技术和电气信息技术领域高层次人才培养和科学研究的重要基地。
6.吉林大学和平校区
和平校区主要为原军需大学，2004年正式并入吉林大学后，改为“吉林大学农学部”;2015年改称，吉林大学西区。吉大和平校区有现有兽医药理、动物机能、动物遗传、生物技术、人兽共患病、实验动物检测、服装工艺、食品安全、园艺、植物分子生物学和外语语言等30多个教学科研实验室。