水堡镇的历史变迁可以追溯到1953年,当时成立了水堡乡。随着时代的推进,行政区划有过几次变动。1958年,水堡乡并入光辉公社,然后在1962年,龙家庄公社从原乡中析出独立。1984年,随着农村改革的深入,水堡乡再次复置。到了1993年,井子会乡并入,这一系列的整合最终形成了现在的水堡镇。
水堡镇目前下辖11个行政村,这些村落各具特色,包括:
这些村落的编码系统为~200至~210,体现了它们在行政管理中的地位和识别性。水堡镇的变迁见证了中国农村行政区划的演变历程,每个村庄都是这个镇历史长河中不可或缺的一部分。