健全完善地质找矿新机制核心问题是处理好政府和市场的关系，建立使市场在矿产资源配置中起决定性作用的新机制——“市场配置，企业主体，政府调控”。
1.明确“矿业”产业定位，实行勘查开发统一管理
一是明确矿业产业定位。我国在计划经济体制下形成的探采分离体制，源于把矿产资源勘查划归第三产业，把矿产资源采选划归第二产业，这不符合市场规律，与我国市场经济体制不相适应。在市场经济体制下，探采一体（机制上）不可分割，把勘查与开采一起归类为“矿业”，定位为第一产业，有理论根据，符合世界惯例。
二是深化经济体制改革，实行“职能有机统一的大部门体制，健全部门间协调配合机制”，建立新型的矿业管理体制，实行矿业“横向集中统一、纵向分级分类管理”的体制。解决目前探采分离，管理上横向政出多门，纵向争权逐利的问题，解决机构重叠、职责交叉的问题。
2.发挥好法律、法规的间接管理和政策的调控作用
建议修改《矿产资源法》。对矿产资源关乎国家安全、经济社会可持续发展、惠泽民生、代际补偿作出法律规定；明确以生态文明建设统筹矿产资源勘查开发与环境保护、节约集约利用资源的基本国策；作出与《物权法》相适应的矿业权用益物权相关法律规定，形成新形势下矿产资源保护与矿业发展的法律保障。
建议对现行征收资源税费的办法进行调整。我国现行矿产资源税费制度，已不适应矿产资源勘查开发新形势，不利于节约集约利用资源，造成矿产品价格不合理，矿业收益分配不公，不利于矿业发展方式转变。主要问题是作为对资源性资产耗竭的货币性资产补偿的资源补偿费费率偏低（平均1.18%），补偿不足；对矿产资源作为资源性资本在生产经营活动中产生级差收益调节的资源税目前只部分征收，从量计征，应扩大征收范围，从价计征。
建议解决矿业权“价款”制度异化问题。目前矿业权“价款”未按国务院文件征收，发生“异化”。混用“有偿”和“价款”概念，“价款”范围扩大，有些地方所有探矿权、采矿权不论投资主体，不管是否形成矿产地，都收“价款”；有些地方将开采预期收益提前全额征收，数额越来越大，远远超出资源补偿费和资源税，实际上是在炒卖资源。“价款”制度异化，扰乱了矿业市场，造成矿产资源收益分配不公。要准确划分国家所有权益与勘查投资权益，建立矿产资源国家所有权益和勘查投资权益分体运行机制，调整二者处置方式。修改完善评估理论方法及相关准则体系。在市场经济条件下，“矿业权价值”（投资人权益）应由市场决定，不同所有制矿业权人在市场上平等交易。
建议解决一些地方“基金”的错位问题。地质勘查基金是在我国地质勘查风险资本市场尚未建立的情况下设立的，理应是降低勘查风险，引导社会资金，进行商业性矿产勘查，间接起到对商业性地质勘查的融资作用。而现在一些地方政府把地质勘查基金的使用等同于政府投入找矿，与市场争权，与企业争利，挤出社会资金。
3.深化行政体制改革，处理好政府和市场的关系
一是转变政府职能，做好公共服务。深化行政体制改革，推进政企分开、政资分开、政事分开、政社分开，深化行政审批制度改革，继续简政放权，推动政府职能向为找矿突破创造良好发展环境，提供优质公共服务，维护社会公平正义转变。解决目前一些地方政府在矿产资源勘查开发中还存在着过多的行政管理，还存在着政企不分、政资不分、政事不分和政社不分的问题，还有政府掌控矿业权，集管理者所有者经营者于一身的问题。
二是规范政府投入，处理好政府投入与社会投入的关系。部推行“公益先行、商业跟进、基金衔接、整装勘查、快速突破”的地质找矿新机制，核心内容是不同投资主体的投资方式及其经济关系。为完善地质找矿新机制，需要规范投入，尤其是规范政府投入。目前多数省（区、市）地质找矿资金主要来源于“资源补偿费”和“价款”，多以“省财政”和“省基金”形式投入，政府持有矿业权。要规范“省财政”“省基金”投入地质找矿运作方式，纠正政资不分、政企不分、政事不分、政府掌控甚至垄断矿业权问题，发挥市场配置资源的作用，推动找矿突破战略行动健康发展。
4.尊重市场规律，健全完善矿业权市场
要使市场在配置矿产资源中起决定性作用，首先要建立健全全国统一、竞争、开放、有序的矿业权市场和矿业要素市场。要建立健全矿业权市场运行规则，规范矿业权市场运行。目前实施的矿业权出让是政府采用市场办法的调控手段，不是市场配置资源，而转让市场才是真正的市场配置。要加强矿业权转让市场建设，积极发挥市场配置资源的基础性作用。
要建立健全与矿业权市场相配套的市场体系。严格准入制度，规范市场行为；构建矿产勘查的融资平台，建立合理的矿产勘查投资结构和风险激励机制，规范矿业资本市场。
要规范中介组织，更好地发挥行业协会作用。对现有的中介组织进行整顿，规范资质，严格把关，加强自律，提高水平，建立诚信。
5.激发各类矿业市场主体发展新活力
深化改革，激发各类矿业市场主体发展活力。一是深化国有矿业企业改革，改制成股份制公司体制，像甘肃白银有色集团股份有限公司、海南石碌铁矿股份有限公司，从计划经济体制下探采分离转变为市场经济条件下探采（机制上）一体，建立科学的法人治理结构，实现所有权和经营权分离，国有控股和参股从制度上解决政企分开的问题。以产权制度改革增强动力、激发活力，积极发挥市场主体作用。
二是引导扶持发展非公有制矿业企业。非公有制矿业企业随着我国经济体制改革深化和矿业发展方兴未艾，已经成为重要的矿业市场主体。要认真贯彻实施十八大报告提出的两个毫不动摇（毫不动摇巩固和发展国有经济；毫不动摇鼓励、支持、引导非公有制经济发展），破除“姓国姓民”桎梏，对非公有制经济一视同仁，平等对待，同等使用生产要素，平等受到法律保护，支持非公有制矿业企业发展，为找矿突破作出贡献。