小规模纳税人是可以自行完成账务处理的。但需确保负责做账的人员具备会计资格证书，并且会计与出纳的角色应由不同的人担任，以保持职务上的分离。《会计法》规定了以下几点：（1）各企业必须依法设置会计账簿，并保证其内容的真实性和完整性。企业必须根据实际的经济业务活动来执行会计核算工作，包括填制会计凭证、登记会计账簿、编制财务会计报告。（2）企业应当根据会计业务的需求，设立会计机构，或者在已有的机构中指定会计人员并指定会计主管。如果条件不允许，应委托经批准设立并从事会计代理记账业务的中介机构来代理记账。（3）从事会计工作的人员，必须取得会计从业资格证书。出纳人员不得同时负责审核、保管会计档案以及登记收入、支出、费用、债权和债务等账目。
从事小规模纳税人手工账务处理时，应确保：1）确定使用手工记账后，向税务机关申报并备查，购买规定的明细账簿和总账账簿。2）不能一个时期手工记账，另一个时期使用电脑记账。应根据实际发生的业务，手工填写记账凭证。3）即使有电脑账，电脑生成的凭证也必须与手工凭证一致。4）使用电脑记账时，可以机打账簿，一旦账簿确定，不得更改、撕毁或空页。
小规模纳税人只能开具普通发票，因此不存在增值税的抵扣问题。购进货物时的增值税通常记入购入货物的成本中。
不按时记账和报税对企业会产生以下不利影响：1）公司每年可能会被税务局罚款2000元至1万元。2）企业欠税，法定代表人可能会被限制出境，以及无法购买飞机和火车票。3）企业长期不报税，税务局可能会上门查账。4）长期不报税可能导致发票机被锁定。5）进入工商经营异常名录；税务非正常；所有对外申办业务将受到限制，如：开设银行账户、进驻商城等。
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