近年来，益生菌广泛应用于健康医疗、食品工业、动物健康养殖、农业种植等生命健康领域，市场增长显著，发展前景广阔。随着国内消费市场对益生菌产品的需求大幅增加，益生菌迎来了井喷式发展。但是，很多人对益生菌的概念，还不太清楚。
益生菌，是一类对人体有益的活性微生物，是定植于人体肠道、生殖系统内，能产生确切健康功效从而改善人体微生态平衡、发挥有益作用的活性有益微生物的总称。
益生菌被世界卫生组织定义为：“活的微生物，当摄入足够量时，能够对人体健康产生有益影响”。
国家对于益生菌类保健食品的原料菌种，都实行名单制管理。
目前，国家批准的可食用的益生菌，主要有六种，即：乳双歧杆菌，嗜酸乳杆菌，婴儿双歧杆菌，长双歧杆菌，鼠李糖杆菌，干酪乳杆菌。
国家监管机构发布的《可用于保健食品的益生菌菌种名单》《可用于食品的菌种名单》和《可用于婴幼儿食品的菌种名单》中所列的各菌种，都是由国家卫健委评审和批准。可见，“益生菌”并不是随便定义。
2019年3月20日，国家市场总局就《益生菌类保健食品申报与审评规定》益生菌类保健食品限定为“活的微生物”，而“死菌及其代谢产物”已被排除在外。所以，死亡的益生菌都不得以“益生菌”命名。
“金花菌”是一种对人体有益的菌，它的组织结构物质，包括初级代谢物和次级代谢物等，都包含着对人体有益的
成分，具有营养和保健功能。但是，我们食用金花菌，并不需关心它是否活着，而是要关心它营养成分多少。人们喝茶或食用“金花菌”，吃的是它的“灭活体”和营养成分，而不是吃它的“活体”。
“金花菌”是一种兼性好氧真菌，它并不能在人体无氧的肠道中长期生存，它也无法耐受肠胃中各种消化酶类的腐蚀和氧化，很难在人体中保持所谓的“活”性。
研究证明“金花菌”是一种“绝对无毒性”代谢的真菌，其“活体”菌，对人体也没有任何危害，即便在人体内定植，也是绝对安全的。
所以，不是所有对人体有用的菌，都称为“益生菌”。