开环质粒DNA和线性DNA哪个跑的快

如题所述

线性DNA的电泳迁移速率比开环质粒DNA快。

蛋白质和核酸会根据pH不同带有不同电荷,在电场中受力大小不同,因此跑的速度不同,根据这个原理可将其分开。电泳缓冲液的pH在6~9之间,离子强度0.02~0.05为最适。

常用1%的琼脂糖作为电泳支持物。琼脂糖凝胶约可区分相差100bp的DNA片段,其分辨率虽比聚丙烯酰胺凝胶低,但它制备容易,分离范围广。普通琼脂糖凝胶分离DNA的范围为0.2-20kb,利用脉冲电泳,可分离高达10^7bp的DNA片段。

扩展资料

凝胶浓度

对于琼脂糖凝胶电泳,浓度通常在0.5~2%之间,低浓度的用来进行大片段核酸的电泳,高浓度的用来进行小片段分析。低浓度胶易碎,小心操作和使用质量好的琼脂糖是解决办法。注意高浓度的胶可能使分子大小相近的DNA带不易分辨,造成条带缺失现象。

缓冲液

常用的缓冲液有TAE和TBE,而TBE比TAE有着更好的缓冲能力。电泳时使用新制的缓冲液可以明显提高电泳效果。注意电泳缓冲液多次使用后,离子强度降低,pH值上升,缓冲性能下降,可能使DNA电泳产生条带模糊和不规则的DNA带迁移的现象。

参考资料来源:百度百科-DNA分子

参考资料来源:百度百科-开环DNA

参考资料来源:百度百科-琼脂糖凝胶电泳

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第1个回答  2019-07-07

线性DNA的电泳迁移速率比开环质粒DNA快。

一、详细讲解如下:

1、琼脂糖凝胶电泳DNA 迁移速率与分子大小和构象相关,分子构象越大,摩擦阻力越大,第一条带是超螺旋带应该最亮,因为超螺旋结构完整紧密,跑得最快。

2、第二条带为线性质粒是双链都断开变成松弛的线性DNA,不如超螺旋紧密,跑得相对慢 。第三条带为开环质粒,DNA双链的其中一根断开,导致超螺旋能量被释放而使质粒变成松弛的环状结构,结构臃肿,跑得最慢。

3、由于摩擦阻力的问题,琼脂就像有孔海绵分子筛,细菌质粒提取中电泳会出现三条带,最快的是超螺旋带,它是完整的,因为它的构型紧密,跑得快。

4、 第二条带在中间,是线性带,即环状双链DNA 两条链均断开,其分子构象变为线性,不如超螺旋紧密,跑得就慢一点。最慢的是开环带,即环状双链DNA 有一条链断开,拖着一条尾巴,显得很臃肿,所以跑得最慢。

二、参数理解:

1、蛋白质和核酸会根据pH不同带有不同电荷,在电场中受力大小不同,因此跑的速度不同,根据这个原理可将其分开。电泳缓冲液的pH在6~9之间,离子强度0.02~0.05为最适。

2、常用1%的琼脂糖作为电泳支持物。琼脂糖凝胶约可区分相差100bp的DNA片段,其分辨率虽比聚丙烯酰胺凝胶低。

3、但它制备容易,分离范围广。普通琼脂糖凝胶分离DNA的范围为0.2-20kb,利用脉冲电泳,可分离高达10^7bp的DNA片段。

扩展资料:


一、开环质粒DNA之间线性DNA的理解

1、取决于分子量大小和体积分子量小体积小的物质电泳迁移速度快 这个是学生化的常识啊共价闭合环状DNA结构紧凑 体积小 所以最快同理 其次为线装 开环线状你应该可以理解。

2、主要说说开环 开环就是双链DNA中的其中一条链短裂 然后此时的DNA分子就会变成环状分子 变成一大团东西 此时的体积就比线状大很多了 所以开环速度最慢,开环质粒DNA比线性DNA慢的原理解释。

二、开环质粒DNA比线性DNA移动慢的原理解释

1、对于琼脂糖凝胶电泳,浓度通常在0.5~2%之间,低浓度的用来进行大片段核酸的电泳,高浓度的用来进行小片段分析。

2、低浓度胶易碎,小心操作和使用质量好的琼脂糖是解决办法。注意高浓度的胶可能使分子大小相近的DNA带不易分辨,造成条带缺失现象。

3、缓冲液常用的缓冲液有TAE和TBE,而TBE比TAE有着更好的缓冲能力。电泳时使用新制的缓冲液可以明显提高电泳效果。

4、注意电泳缓冲液多次使用后,离子强度降低,pH值上升,缓冲性能下降,可能使DNA电泳产生条带模糊和不规则的DNA带迁移的现象。

参考资料来源:百度百科-DNA分子

参考资料来源:百度百科-开环DNA

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第2个回答  2019-07-04

线性DNA的电泳迁移速率比开环质粒DNA快。

琼脂糖凝胶电泳DNA 迁移速率与分子大小和构象相关,分子构象越大,摩擦阻力越大,第一条带是超螺旋带应该最亮,因为超螺旋结构完整紧密,跑得最快。第二条带为线性质粒是双链都断开变成松弛的线性DNA,不如超螺旋紧密,跑得相对慢 。第三条带为开环质粒,DNA双链的其中一根断开,导致超螺旋能量被释放而使质粒变成松弛的环状结构,结构臃肿,跑得最慢。

扩展资料:

由于摩擦阻力的问题,琼脂就像有孔海绵分子筛,细菌质粒提取中电泳会出现三条带,最快的是超螺旋带,它是完整的,因为它的构型紧密,跑得快。 第二条带在中间,是线性带,即环状双链DNA 两条链均断开,其分子构象变为线性,不如超螺旋紧密,跑得就慢一点。最慢的是开环带,即环状双链DNA 有一条链断开,拖着一条尾巴,显得很臃肿,所以跑得最慢。

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第3个回答  2017-07-07
我硕士专业是分子生物学这方面的,我可以很负责地告诉你,质粒DNA分子具有三种构型:共价闭合环开DNA(cccDNA,SC构型)、开环DNA(OC构型)和线性分子(L构型).在细菌体内,质粒DNA是以负超螺旋构型存在的.在琼脂糖凝胶电泳中不同构型的的同一种质粒DNA,尽管分子量相同,但具有不同的电泳迁移率.其中跑在最前沿的是共价闭合DNA,其后依次是线性DNA和开环DNA,其原因是共价闭合的DNA其空间位阻最小,所以跑得最快.而开环DNA空间位阻最大,所以跑得最慢. 这些结论都是经得起实验考验的,我在做质粒的上有没有这个酶切位点鉴定的时候,我就会用原质粒和经过单酶切的质粒在同一块胶上进行电泳,看单酶切后的质粒是不是比原质粒跑得快从而鉴定出质粒有没有被切开.这个也分子生物学领域应用很广泛,PCR-RFLP方法就是基于这个原理进行限制性内切酶图谱方面的鉴定的.本回答被网友采纳
第4个回答  2019-02-19
我硕士专业是分子生物学这方面的,我可以很负责地告诉你,质粒DNA分子具有三种构型:共价闭合环开DNA(cccDNA,SC构型)、开环DNA(OC构型)和线性分子(L构型).在细菌体内,质粒DNA是以负超螺旋构型存在的.在琼脂糖凝胶电泳中不同构型的的同一种质粒DNA,尽管分子量相同,但具有不同的电泳迁移率.其中跑在最前沿的是共价闭合DNA,其后依次是线性DNA和开环DNA,其原因是共价闭合的DNA其空间位阻最小,所以跑得最快.而开环DNA空间位阻最大,所以跑得最慢.
这些结论都是经得起实验考验的,我在做质粒的上有没有这个酶切位点鉴定的时候,我就会用原质粒和经过单酶切的质粒在同一块胶上进行电泳,看单酶切后的质粒是不是比原质粒跑得快从而鉴定出质粒有没有被切开.这个也分子生物学领域应用很广泛,PCR-RFLP方法就是基于这个原理进行限制性内切酶图谱方面的鉴定的.
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