都不错，区别是历史不同、居住学生不同。
一、历史不同：南京大学鼓楼校区为南京大学三大校区之一，全国重点文物保护单位金陵大学旧址所在地。1952年南京大学由四牌楼迁往鼓楼办学，鼓楼校区也成为南京大学主校区，直至南京大学仙林校区启用。 南京大学仙林校区建设得到大量社会捐赠，几乎每幢楼每个建设项目都有校友、政府援建。仙林校区2009年9月投入使用，2012年成为南京大学主校区。2012年，国际小行星命名委员会批准国际编号为187707的小行星正式命名为“南大仙林星”。
二、居住学生不同：仙林校区目前在1-3年级，所有本科生都将留在仙林校区。仙林位于南京大学仙林校区，2地铁线路；鼓楼校园是一名大四学生和一名研究生。
三、建筑形式与用途不同。
1、鼓楼校区：中华传统风格建筑群，全国重点文物保护单位金陵大学旧址所在地。1952年南京大学由四牌楼迁往鼓楼办学，鼓楼校区也成为南京大学主校区。其中的北大楼已经成为南京大学的标志性筑。 用于本科四年教学、硕士教学与博士教学。 2、仙林校区：建筑大多棱角分明，方方正正，远观整齐划一，独立的内部庭院形成各自独立的生态系统。为创建世界一流大学而建设的国际化新校区。校区建设按照一次规划，分步实施原则进行。 用于本科一至三年级教学。
2、浦口校区：为南京大学在新世纪的可持续发展提供了广阔的办学空间，它与鼓楼校区形成隔江并峙，协调发展的办学新格局。着力培养大学生的科学素养与人文精神、创新意识和实践能力，初步形成了强化拓宽基础、早期科研训练的特色。 用于独立三本学院，南京大学金陵学院。
南京大学（Nanjing University），简称“南大”，位于江苏省南京市，是中华人民共和国教育部直属、中央直管副部级建制的全国重点大学，位列国家“双一流”、“985工程”、“211工程” 重点建设高校，入选“珠峰计划”、“强基计划”、“111计划”、“2011计划”，为九校联盟（C9）、中国大学校长联谊会、环太平洋大学联盟、21世纪学术联盟、全球大学高研院联盟、国际应用科技开发协作网、东亚研究型大学协会、新工科教育国际联盟、中国高校行星科学联盟、长三角研究型大学联盟、学位授权自主审核单位成员，首批国家级双创示范基地。
南京大学肇始于1902年创建的三江师范学堂，此后历经两江师范学堂、南京高等师范学校、国立东南大学、国立中央大学等历史时期，1950年更名为南京大学。1952年，调整出部分院系后与创办于1888年的金陵大学文、理学院等合并，仍名南京大学。校址从四牌楼迁至鼓楼金陵大学原址。2006年，教育部和江苏省签订重点共建南京大学的协议。2011年，教育部和江苏省签署协议继续重点共建南京大学。
截至2022年5月，学校有四个校区，33个院系，本科生13350人、硕士研究生17201人、博士研究生8385人、留学生1117人。现有一级学科国家重点学科8个，二级学科国家重点学科13个，“双一流”建设学科16个，本科专业89个，博士学位授权一级学科点42个，博士学位授权二级学科点1个，专业博士学位授权点5个，硕士学位授权一级学科点4个，专业硕士学位授权点28个，博士后流动站38个。