究其原因，多与水分障碍、施肥不当和地下病虫害有关。水分障碍土壤湿度过大或过小，都会影响植株根系的发育，造成根系喜水喜肥困难，从而造成黄瓜瓜苗不长，建议瓜农对地下水位高，土壤湿度大的地块，应开深沟，做高畦，增施有机肥，定植后及时中耕，否则应深栽瓜苗，中耕松土保墒。施肥不当基肥施得过深，肥料肥料养分未跟上，或施肥不当烧根烧叶，从而造成黄瓜瓜苗不长，建议瓜农科学施肥，适时浇水，以湿透床土为宜。地下病虫害根系遭受瓜实蝇、
地老虎等害虫的伤害也会使黄瓜瓜苗不长。若发现地下害虫咬食幼苗，建议瓜农撒施毒饵诱杀。这里要提醒瓜农谨防黄瓜根结线虫，该线虫自黄瓜幼苗移栽后即可为害，二龄幼虫从根尖侵入，寄生在
根组织当中取食为害并逐步发育成高龄虫。在侵害时线虫会通过锋利的口针穿刺根系，造成机械损伤，伤口为土壤中其它的病菌、病害入侵提供有利的条件。建议瓜农在黄瓜移栽前用盈辉杀线剂颗粒与肥混合沟施、穴施或全田撒施，持效期能达2-3个月；如果黄瓜是在生长期受到危害，则用盈辉杀线剂蓝利根砂兑水灌根、冲施即可，能快速有效杀死根结线虫，避免出现黄瓜缺肥的现象。