保姆级别qRT-PCR从理论知识(△Ct,△△Ct,2^-△△Ct)到实践操作

如题所述

深入探索:保姆级qRT-PCR:理论与实践的艺术


实时定量反转录PCR(qRT-PCR),如同科研领域的里程碑,它将PCR技术推向了一个全新的定量时代。通过引入特异性的寡核苷酸探针(qPCR探针),这项技术实现了对PCR过程中产物的实时监测与精确计数,使得基因表达分析、病原体检测等生物科学实验如虎添翼[1]。


qRT-PCR,全称定量逆转录聚合酶链反应,以cDNA(从mRNA逆转录生成的DNA)为模板,广泛应用于基因表达研究和疾病诊断。cDNA的单链或双链取决于具体实验,例如在RT-PCR中,我们通常使用单链cDNA,而在构建表达载体或qRT-PCR中则需双链形式[2]。cDNA的独特之处在于,它是mRNA转录的产物,因此只包含外显子,不含内含子,这源于mRNA剪切过程[3]。


qRT-PCR的运作过程,如同一场精密的舞蹈,包括探针标记、荧光染料应用和荧光值记录等步骤。TaqMan技术是其核心,利用TaqDNA聚合酶的5'核酸酶活性,荧光探针在PCR反应中被切割,从而产生可读信号[4]。图1展示了qRT-PCR的基本原理。


理解qRT-PCR的专业术语至关重要,如基线、ΔRn、阈值和Ct值。基线定义为信号积累但未达到检测极限的PCR周期。Ct值,即循环阈值,是表达量的直接衡量,是qRT-PCR实验的核心数据[5]。图2展示了实时荧光定量反转录PCR的工作流程。


从操作到实践:qRT-PCR的详细步骤


在实践中,qRT-PCR的每一步都需精确执行。以96孔板为例,合理的布板设计(表1)是关键。上样时,遵循试剂盒指示,包括引物、cDNA模板和ddH2O等(表2)。qRT-PCR的扩增程序包括变性、退火和荧光数据采集(表3),而溶解曲线的获取也是标准步骤。


数据处理采用经典的2^-△△Ct公式(表4),Excel提供了方便的工具,如t-test(图4-5)进行统计分析。通过比较对照组和处理组的数据,我们可以得出显著差异的结论,这为实验结果提供了坚实的基础。


最后,图形化数据是结果呈现的重要方式,无论是Excel、Origin还是GraphPad,都能帮助我们清晰呈现实验结果(图5)[6]。记住村上春树的教诲,无论外界如何看待,保持自我,坚持科研,你的努力终将得到回报[7]。



[1] Reference: 未提供
[2] Reference: 未提供
[3] Reference: 未提供
[4] Reference: 未提供
[5] Reference: 未提供
[6] Reference: 未提供
[7] Reference: 未提供
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