农合二次报销比例各地略有不同。 通常情况下，新农合患者在镇级医院住院治疗起付线为100元/人次，报销比例是合规费用的100%; 市内县级定点二级医院住院治疗起付线600元/人次，报销比例为80%; 市内市级定点二级医院住院治疗起付线1000元/人次，报销比例为70%; 市内市级三级定点医院住院治疗起付线1800元/人次，报销比例为60%; 省级三级定点医院住院治疗起付线3000元/人次，报销比例为55%; 省级二级定点医院住院治疗起付线2000元/人次，报销比例为65%; 市内定点民营医院报销比例比照市级二级定点医院报销比例下降5个百分点，在市内未定点医院报销比例比照市级定点医院报销比例下降10个百分点，起付线不变。 《中华人民共和国 社会保险法 》第三十条 下列 医疗费用 不纳入基本 医疗保险 基金支付范围: (一)应当从 工伤保险 基金中支付的; (二)应当由第三人负担的; (三)应当由公共卫生负担的; (四)在境外就医的。 医疗费用依法应当由第三人负担，第三人不支付或者无法确定第三人的，由基本医疗保险基金先行支付。基本医疗保险基金先行支付后，有权向第三人追偿。