水化学环境背景值的确定是进行水质评价和污染状况分析的基本前提，直接影响到水质状况和污染程度评价的质量与正确程度。
天然水中砷含量极低，淮南市区浅层地下水中最高含量为0.001mg/L，其中大通塘所在的东部平均0.0038mg/L，谢二塘所在的西部是0.0029mg/L，潘三塘所在的北部是0.0037mg/L。氟在淮南地区浅层地下水中的含量一般也不高，多在1.0mg/L以下(约占88%)，但局部地区富集，其含量北部最高，平均为0.745mg/L，修正个别离散值的影响，平均仍达0.5mg/L，东部是0.36mg/L，西部是0.31mg/L。淮南地区浅层地下水中多数样品未检出Se，局部地区含量为0.001～0.004mg/L，多分布在淮河以南的东、西部。东部为4.35×10-4mg/L，西部为9.74×10-4mg/L，北部为1.69×10-4mg/L(桂和荣等，2001)。汞是具有较大毒性的微量元素，天然水中含汞多来源于工业废水，在淮南市区浅层地下水中基本无汞存在，均在0.002mg/L以下。