植物病害的种类可以有多种分类方法。按传播方式和介体可以分为土传病害、种传病害、气传病害、介体传播病害等；按寄生受害部位可以分为根部病害、茎部病害、叶部病害、果实病害等。但最客观也最实用的还是按照病因类型来分类，它的优点是既可以知道发病原因，又可以知道病害发生特点和防治的对策等。根据这一原则，植物病害可以分为两大类，第一类是有病原生物因素造成的病害，称为侵染性病害；另一类是没有病原生物参与，只是由于外界环境条件的恶化或者植物自身的原因所引起的病害，称为非侵染性病害，亦称生理性病害。
（1）按照病原生物种类的不同，侵染性病害还可以进一步分
①由真菌侵染引起的真菌病害 如黄瓜霜霉病、番茄早疫病等。
②由细菌侵染引起的细菌病害 如白菜软腐病、番茄青枯病等。
③由病毒侵染引起的病毒病害 如黄瓜花叶病毒病、番茄病毒病等。
④由线虫侵染引起的线虫病害 如黄瓜根结线虫病、大豆孢囊线虫病等。
⑤由寄生植物引起的寄生植物病害 如菟丝子。
（2）按照病因的不同，非侵染性病害可以分三类
①遗传或生理病害 植物自身遗传因子或先天性缺陷引起的遗传性病害或生理病害。
②环境因素恶化所致的病害 如高温灼伤、冻害、盐渍害等。
③化学因素恶化所致的病害 如药害、缺素、有害气体毒害等。
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