1、概念不同
将军一般是高级军事将领的统称，不同朝代、国家其具体指代不同：中国古代常作为高级武官、军政官员的职位甚至是爵号；日本幕府时期，将军是日本的最高权力者；近现代，多用于称呼军队中的将级军官。
元帅在历史上曾经有过两种含义：一是官职名称，二是军衔称号。“元帅”一词源自上古德语中的“马”和“仆人”。
2、出现时间不同
作为高级军事统帅，“将军”早在二千多年前就出现了。
我国最早出现元帅是在公元前633年的春秋时期，其名源于《左传·僖公二十七年》所载晋文公的“谋元帅”，即考虑中军主帅人选，晋国名将先轸在城濮之战与崤之战中屡立战功便成为了我国历史上第一位有元帅头衔并有着元帅战绩的军事统帅。
3、级别不同
元帅代表着军事上的最高统帅，一个国家里面如果同时有将军和元帅两个称号，元帅是肯定要大于将军的（指的是最高级别），比如我国成立之后就按战功大小评出了十大将军和十大元帅，十大将军非别是粟裕、徐海东、黄克诚、陈赓、谭政、肖劲光、张云逸、罗瑞卿、王树声、许光达。
参考资料来源：百度百科-将军
参考资料来源：百度百科-元帅
元帅是军队里最显赫的头衔，在中国古代最早是统帅全军的军事一哥，到南北朝时期，元帅开始正式成为统领全军的官职名称，后来就有些泛滥了，一般作为率军作战的主帅，相当于二战时期的方面军司令吧。
从16世纪的法国军队开始，元帅一词用以表示军队的最高军衔。到了第一次世界大战和第二次世界大战，很多国家都设有元帅军衔，苏联甚至设有苏联大元帅、苏联元帅和苏联海军元帅 、军兵种主帅和军兵种元帅四个元帅等级军衔。例如苏联陆军的军兵种元帅还分为炮兵元帅、装甲兵元帅、工程兵元帅、通信兵元帅等。
中国人民解放军在1955年首次授予军衔，将军级分为少将，中将，上将，大将，元帅是最高军街。有十位战功卓著的军事家被授予中华人民共和国元帅军衔。一开始我军还有设立大元帅的构想，理由是苏联的斯大林就被授予大元帅，所以我军也理应有大元帅，军方还制作了一套大元帅军衔和礼服。不过，这事被拒绝了。
1988年，我军实行新军衔制的时候，取消了元帅军衔，最高军衔为上将。这也符合国际潮流，目前大多数国家已经取消了元帅军衔。就是俄罗斯也取消了苏联式的元帅军衔，只有俄罗斯海军还保留俄海军元帅的军衔，不过从没授予过，现任俄罗斯海军总司令科罗廖夫，军衔也仅为上将。
在第二次世界大战中，德国的元帅区分为帝国元帅和军种元帅两个级别。到了上世纪80年代，在主要军事强国里，都取消了元帅军衔。和平年代，一般不设元帅军衔，非举国大战，一般不授予元帅军衔，这已经成为各国共识。只有极少数国家还保留着元帅、主帅和次帅等古老军衔。目前世界主要军事强国里唯一的元帅在印度，2002年阿尔琼辛格被授予印度空军元帅军衔。
来源：科罗廖夫
元帅下面是将军。
首先元帅和将军是军衔，司令是职务。
中国在建国初期，设十大元帅、十大将，是功勋军衔，
也就是说，只有这二十个人有些殊荣；
中国还曾设想为毛泽东设立大元帅，当时军衔已经造好，
但毛泽东拒绝了。
正规的军衔里，是没有元帅的，中国军衔最高为上将。
司令一词，本来的意思，是一个军职，比如以前常讲的宪兵司令。属作战单位的，一个作独立作战单位，设一个司令官，意为全权负责。
我军目前实行的军衔制，不同于上述三种类型。我军军官衔级的设置在世界上是独一无二的，共设三等十级：
将官三级：上将、中将、少将；
校官四级、大校、上校、中校、少校；
尉官三级：上尉、中尉、少尉。
我军新军衔制与其他几种军衔类型相比：
比"东方型"军衔少元帅、大将、大尉等衔，多大校，比前苏联少三级，比其他国家少一至二级；
比"西方型"军衔少元帅、准将，多大校，上将以下军衔等级一样多；比"东亚型"军衔多大校一级。
应该说，比较而言，我国新军衔制在军衔设置上，更接近传统的"西方型"军衔，至少军衔等级一样 多。所不同的是"西方型"军衔有元帅和准将，我军军衔制在相应的位置上是一级上将和大校（1994年取消了一级上将，而西方国家的元帅平时基本不用）。我军平时最高军衔为上将，这一点和大多数国家一样，我军的大校和朝鲜一样主要是为师职干部设的。由于我军师职干部数量太多，如果大部分授少将，将官数量过多；如大部分授上校，则显得偏低；如设准将军衔，将官数量更多，因此设置大校衔。这样，我军的编制军衔就比较特殊，尉官对应连、排军官，这一点与其他几种类型军衔制样；而将官对应军以上军官，校官对应师、团、营军官，则是具有中国特色的。
首先元帅和将军是军衔，司令是职务。
中国在建国初期，设十大元帅、十大将，是功勋军衔，
也就是说，只有这二十个人有些殊荣；
中国还曾设想为毛泽东设立大元帅，当时军衔已经造好，
但毛泽东拒绝了。
正规的军衔里，是没有元帅的，中国军衔最高为上将。
司令一词，本来的意思，是一个军职，比如以前常讲的宪兵司令。属作战单位的，一个作独立作战单位，设一个司令官，意为全权负责。