办学主体不同、办学层次不同、学校名称不同、学历证书不同、时间不一样、数量不一样就是独立学院与民办大学的两者之间的区别。
独立学院是本科，而民办学院是本科、专科都有。独立学院是按照教育部行政规章设立的，而民办学院是按照民办教育促进法设立的。民办学院有自己的校名、组织机构、师资力量和自己独立颁发的毕业证书。但是独立学院一般都是在某个大学名下设立的，可能会和挂名大学在同一个校园，也可能在师资量方面有共享，这是民办学院没有的优势。
具体情况如下：
办学主体不同
民办院校的办学主体是社会力量办学，包括个人或者社会机构办学；独立学院的办学主体是普通高校，合作者是社会力量。民办院校是按照民办教育促进法设立的，独立学院是教育行政规章设立的。
办学层次不同
独立学院是指实施本科以上学历教育的普通高等学校与国家机构以外的社会组织或者个人合伙创立，因此独立学院一定是本科。而民办高校中专、本科都有。
学校名称不同
从学校名称上看，民办院校都有自己的校名，而独立学院则是设立在某一个大学名下，比如厦门大学嘉庚学院、四川大学锦江学院、吉林大学珠海学院、燕山大学里仁学院、中国传媒大学南广学院等。
学历证书不同
独立学院和民办院校的毕业生都可以获得国家承认的学历证书，毕业证书均可以在中国高等教育学生信息网上查询得到。但是，独立学院毕业证书上加盖的是某某大学某某学院的印章，而学校本部学生的毕业证书只盖有自己学校校名的印章。而民办院校的毕业证书上印章就是学校校名。
时间不一样
中国独立学院产生于1998年，以苏州大学与苏州大学教育发展基金会举办的中国第一所独立学院苏州大学文正学院成为标志。而中国民办高校已经有30余年历史。
数量不一样
截至2017年，独立学院有260所。截至2018年03月05日，全国独立设置民办普通高校467所（含中外合作办学11所）。
学费
独立学院的学费每年再1万元以上
民办学院的学费没年在1万至2万不等
两者相比，到底哪种更好呢？
独立学院和民办高校都是三本性质，但是他们却各有各的特点和优势。2008年以前独立
学院可以依托母体院校的名气，并且可以共用资源，预发母体高校的证书，相对更好
些。但是2003年以后经历了改革，一切和往日都存在着不同。同学们无论是想报独立学
院还是民办高校，都要做一番调查
各有各的优势，各有各的特点。因为中国的民办高校发展了二十交年，也有
-些比较好的学校，像北京的城市学院，吉利大学，等等，独立学院应该说是在民办高
校里面算是小弟弟了，时间不是太长，但是独立学院它的优势在于依托于母校的优质的
教育资源，它起点比较高，我觉得这是它的优典所在。
应该说是机遇和挑战并存的，如果说挑战，独立学院办学时间还比较短，办学之初依托
母体学校的资源，优质教育资源的依托就是将来相对的26号令出合以后，我相信母体学
校的支持、指导，包括帮助我们完善评估评价体系。
独立学院和民办大学的区别如下：
1、性质不同。独立学院是本科，而民办学院是本科、
2、开设方式不同。专科都有。独立学院是按照教育部行政规章设立的，而民办学院是按照民办教育促进法设立的。
3、办学的情况不同。民办学院有自己的校名、组织机构、师资力量和自己独立颁发的毕业证书。但是独立学院一般都是在某个大学名下设立的。可能会和挂名大学在同一个校园，也可能在师资量方面有共享，这是民办学院没有的优势。
4、毕业挂名不同。独立学院毕业时，如果成绩好的学生可以推荐使用挂名院校的毕业证书，但是毕业证书上可能会略有差别。但是民办学院会有自己的毕业证书。
以上内容参考 百度百科——独立学院
以上内容参考 百度百科——民办高校
专业老师在线权威答疑 zy.offercoming.com（1）独立学院的性质也属于民办高校。
（2）独立学院与其它民办高校又有一定区别。独立学院一般为公办高校投资兴建，而其它民办高校属于民间投资或外资投资、中外合资承建。