1、系统性能方面的不同
CentOS和Ubuntu用来学习Linux，Ubuntu系统是首选。如果是用来建站的话，最好是选用CentOS系统，CentOS系统都是经过长时间的测试，只有真正稳定的版本才会被发布，所以更加的安全、稳定。
大部分数控制面板，包括主流的cPanel面板，只支持CentOS系统，如果是公司服务器的管理人员，那么CentOS系统肯定是首选。
2、系统稳定性
CentOS：目前CentOS系统更加安全稳定。
Ubuntu：升级包可能会造成系统的不稳定和不安全。
3、系统升级的不同
CentOS：升级不频繁，省事省心。
Ubuntu：升级比较频繁，经常需要更新系统。
4、软件管理
CentOS：使用.rmp包，以及使用yum进行软件管理。
Ubuntu：使用.deb包，以及使用apt-get进行软件管理（部分Ubuntu也支持yum）。