行政绩效评估是政府运作效能的关键，它涉及通过一系列指标来衡量政府的服务质量和效率。核心内容是构建一个全面的指标体系，以适应多元化的公共利益和价值取向。评估指标体系应多元化，避免简化，以体现行政组织的多样价值，同时需与科学发展观和正确政绩观相契合，强调全面、科学和整体的评估。
评估指标体系可以根据内容性质进行分类，如经济发展指标，包括人均国民收入、社会就业率和进出口总额等；社会发展指标，涵盖教育、卫生、环保、社会治安等多方面，具体指标丰富多样；政治发展指标则涉及制度安排和决策民主化等。经济发展、社会进步和政治稳定相互关联，共同构成宏观层面的评估。
从评估方法上看，有学者提出的3E指标（经济、效率和效益）及弗莱恩的4E（加上公平）模型。经济评估关注投入的资源效率，效率评估侧重产出与投入的比例，效益评估重视服务的社会效果，而公平评估则关注弱势群体的权益保障。不同政府部门在实践中会选择适合自己情况的评估指标。
行政绩效评估就是运用科学、客观的方法、标准和程序，对行政绩效信息进行收集、整理、归纳、总结，并在此基础之上进行整体评估的活动，也称为行政绩效考核。 绩效评估实际上是一个循环的流动过程，确定目标→实施评估方案→审查评估方案→目标和实施方案进行修订共四个步骤形成循环周期。