没有最烂的系，只是看符合不符合当代的社会需求。
院系有22个院系：
1.船舶工程学院2.航天与建筑工程学院3.动力与能源工程学院4.自动化学院5.水声工程学院6.计算机科学与技术学院7.机电工程学院8.信息与通信工程学院9.经济管理学院10.材料科学与化学工程学院11.理学院12.外语系13.人文社会科学学院14.国际合作教育学院15.核科学与技术学院16.国防教育学院17.软件学院18.国家保密学院19.思想政治理论课教学研究部20.体育军事训练部21.工程训练中心22.创业教育学院。
学校概况：
哈尔滨工程大学坐落于美丽的松花江畔——北国冰城哈尔滨市。学校前身是创建于1953年的中国人民解放军军事工程学院（“哈军工”）。1970年，以海军工程系全建制及其他系部部分干部教师为基础，在“哈军工”原址组建哈尔滨船舶工程学院；1978年，被国务院确定为全国重点大学；1982年，成为首批具有博士、硕士学位授予权的单位；1994年，更名为哈尔滨工程大学；1996年，进入首批“211工程”建设高校行列；2002年，由国防科工委、黑龙江省人民政府重点共建，同年被教育部批准试办研究生院；2003年，科技部和教育部授予学校科技园“国家大学科技园”称号；2007年，由国防科工委、教育部、黑龙江省人民政府、海军共建，同年教育部批准正式建立研究生院；2011年，进入国家“985工程”优势学科创新平台项目建设高校行列；2017年，进入国家“双一流”建设行列。学校现隶属于国家工业和信息化部，是我国“三海一核”（船舶工业、海军装备、海洋开发、核能应用）领域重要的人才培养和科学研究基地。
学校占地面积125.61万平方米，建筑面积103.54万平方米。校园建筑中西合璧，飞檐碧瓦，气势恢宏。现设有16个专业学院（系、部）；设有40多个科研机构以及150多个科研和教学实验室，其中国家级重点实验室2个，国家工程实验室1个，国家国际科技合作基地3个，工业和信息化部重点实验室5个，国防重点学科实验室2个，教育部重点实验室及工程研究中心5个，国家级学科创新引智基地3个，国家级电工电子教学基地1个，国家级实验教学示范中心7个，国家级虚拟仿真实验教学中心3个，国家大学生文化素质教育基地1个。固定资产总值36.80亿元。图书馆共有纸质藏书226.09万册。
学校现有教职工3006人，其中专任教师1803人，教授、副教授1062人。教师中有“两院”院士8人（含双聘5人），博士生导师477人，享受政府特殊津贴专家100余人，“千人计划”10人，“万人计划”中青年科技创新领军人才2人，教学名师1人，青年拔尖人才5人，“长江学者奖励计划”特聘教授4人、讲座教授3人，青年学者1人，国家杰出青年科学基金获得者1人，国家优秀青年基金获得者2人，教育部“新世纪优秀人才支持计划”入选者24人，教育部创新团队2个，国防科技创新团队6个。各类在校生28278人，其中全日制本科生15124人，全日制研究生7759人，各类外国留学生1348人。学校是首批入选“卓越工程师教育培养计划”高校，并被教育部、总政治部列入“21世纪人才强军计划”，是海军在东北地区唯一选拔培养后备军官的依托学校。
学校紧紧围绕提高人才培养质量这一主题，全面落实立德树人根本任务，深化创新创业教育改革、推动信息技术与教育教学深度融合、推进国际化进程，着力培养“视野宽、基础厚、能力强、素质优、可靠顶用”的一流工程师、行业领军人才和科学家。近年来，学生在中国“互联网+”大学生创新创业大赛、“挑战杯”全国大学生课外学术科技作品竞赛、全国大学生创新创业年会、“创青春”全国大学生创业大赛、国际无人水下机器人大赛等国际国内各类赛事中获得国际和国家级奖逾千项，“E唯”机器人创新团队、“创翼”创新团队获大学生“小平科技创新团队”，大学生创业联盟连续五年获“全国十佳KAB创业俱乐部”。2011年成立创业教育学院。
学校被授予中国青年科技创新行动示范基地、全国五四红旗团委标兵、全国青年就业创业教育先进集体、全国科普教育基地等称号。本科生、研究生一次就业率保持在90%以上，连续十年位列黑龙江省高校第一名，成为全国毕业生就业50所典型经验高校之一。全国百篇优秀博士学位论文及提名获奖占全国船舶与海洋工程学科获奖总数的40%，省优秀硕士学位论文数量连续两年名列黑龙江省第一名。毕业生以“可靠顶用”而受到用人单位的广泛赞誉。2009年，学校被评为全国普通高校毕业生就业工作先进集体。
学校历来有重视科研工作的传统，不仅以国内第一艘实验潜艇、第一艘水翼艇、第一台舰载计算机、第一套条带测深仪等数十项填补国内空白的重大科研成果著称，而且还以双工型潜器、气垫船、梯度声速仪等成果摘取过世界第一的桂冠。学校在船海核领域保持着很强的技术储备，水下机器人、减振降噪、船舶减摇、船舶动力、组合导航、水声定位、水下探测、核动力仿真、大型船舶仿真验证、三体船设计等技术居国内领先或国际先进地位，现已成为我国舰船科学技术基础和应用研究的主力军之一、海军先进技术装备研制的重点单位、我国发展海洋高技术的重要依托力量。
学校坚持国际化、开放式办学。牵头成立国际船舶与海洋工程创新与合作联盟（简称ICNAME）。与包括美国加州大学伯克利分校、美国密西根大学、美国德州农工大学、英国南安普顿大学、澳大利亚悉尼大学、俄罗斯鲍曼国立技术大学以及国际原子能机构、世界五大船级社等世界一流大学、研究机构、国际组织和企业在内的22个国家100余个单位建立了良好稳定的合作关系。学校是“中国政府奖学金”“国家建设高水平大学公派研究生”“创新型人才国际合作培养项目”“优秀本科生国际交流”项目实施高校，获高教学会“全国来华留学工作先进集体”称号。2012年，学校与乌克兰南方师范大学联合成立“孔子学院”。学校每年资助400多名教师到国外进修、讲学和科研合作，每年选派500多名学生到国际知名大学交流学习和访问。
60多年来，学校坚持和发扬老一辈革命家倡导培育的“哈军工精神”，形成了“以祖国需要为第一需要，以国防需求为第一使命，以人民满意为第一标准”的精神追求，凝炼了“大工至善，大学至真”的校训，形成了“忠诚、坚韧、团结、创新”的校风、“治学严谨、组织严密、要求严格”的教风和“严谨、求实、勤奋、创新”的学风。当前，学校以服务国家工业化、信息化和国防现代化为使命，以“双一流”建设为统领，坚定不移走内涵式发展道路，不断提升办学质量和水平，紧紧抓住“三海一核”领域的国家战略机遇，强化特色，继承创新，以人为本，科学发展，正在向着特色鲜明的高水平研究型大学目标阔步迈进。