清华大学的国家重点学科总共有49个，分三大类：
工科类：模式识别与智能控制、设计艺术学、材料学、计算机系统结构、材料加工工程、计算机应用技术、建筑设计及其理论、城市规划与设计、动力机械及工程、电机与电器、水力学及河流动力学、生物化学与分子生物学、电力系统及其自动化、水工结构工程、高电压与绝缘技术、电工理论与新技术、核能科学与工程、核燃料循环与材料、机械制造及其自动化、电路与系统、核技术及应用、机械设计及理论、微电子学与固体电子学、环境工程、车辆工程、通信与信息系统、生物医学工程、光学工程、信号与信息处理、管理科学与工程、精密仪器及机械、控制理论与控制工程、技术经济及管理、供热、供燃气、通风及空调工程
理科类：数量经济学、材料物理与化学、基础数学、应用数学、工程热物理、粒子物理与原子核物理、热能工程、原子与分子物理、结构工程、凝聚态物理、生物物理学、化学工程、固体力学、流体力学、物理电子学。
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