组织机构代码查询和统一社会信用代码的区别是性质不同、组成不同。
一、性质不同：组织机构代码是质监局颁发给企业的证件，与工商登记证、税务登记证是企业的相关证件；统一社会信用代码证是工商局颂发给企业的证件，是三证合一后的统一代码证件。
二、组成不同：统一社会信用代码（18位）包含了组织机构代码（第9-17位）和税务登记证号码（第3-17位），由18位数字或大写拉丁字母组成，包括登记管理部门代码（1位）、机构类别代码（1位）、登记管理机关行政区划码（6位）、主体标识码（9位全国组织机构代码）、验码（1位）五个部分组成；而组织机构代码的唯一性完美“遗传”给统一社会信用代码。
组织机构代码是对中华人民共和国内依法注册、依法登记的机关、企事业单位、社会团体，以及其他组织机构颁发一个在全国范围内唯一的、始终不变的代码标识。国家质检总局负责组织机构代码的管理工作。统一社会信用代码制度是以公民身份号码和组织机构代码为基础的主体标识代码制度。
组织机构代码查询和统一社会信用代码的意义：
对单位法人实行组织机构代码和自然人实行社会保障号码制度，是国家整个经济和社会实现现代化管理的基本制度，尽快建立这一制度对建立社会主义市场经济体制和推动社会进步具有十分重要的意义，且具有紧迫性。实施组织机构代码制度，是随着社会的不断进步而兴起的一种新的现代化管理手段，是实现现代化管理的重要标志。
二十世纪末，发达国家已经普遍实行了代码标识制度，例如欧洲企业注册处始建于1992年，参加EBR的国家已多达20个，通过EBR可以查到欧洲15个国家2000多万企业的基本信息。我国实施组织机构代码标识制度，不仅有利于计算机的自动化管理，实现信息交换和信息资源共享，而且有利于政府各部门、社会各行业充分发挥监督、管理的整体效能。
实施统一社会信用代码制度，是为每个公民、法人和其他组织发放一个唯一的、终身不变的主体标识代码，并以其为载体采集、查询、共享、比对各类主体信用信息，有利于促进信用信息资源共享，降低社会管理成本，提高公共服务水平，完善社会治理体系。