交个人所得税时，个人负担的“五险一金”是可以从工资总额中扣除的，如你的工资总额是3800元，个人负担的“五险一金”是300元，计算个人所得税的基数就是3500元。单位负担的五险一金，与个人无关。五险一金和个人所得税是分开的。根据工资的多少，先缴纳五险一金，再缴纳个人所得税。例：广州某人月工资6000，按规定19%将缴纳社保，那么“应纳税额”=60006000x19%-3500=1360，对应税率和速算扣除数分别为3%和0，因而个=1360x3%-0=40.8元。2018年最新个人所得税计算器，自新个税法实施，起征点从原来的2000元提高到3500元。个税=应纳税额×税率-速算扣除数，其中应纳税额=工资-三险一金-起征点，税率和速算扣除数分别与不同的应纳税额对应。
《个人所得税法》第二条规定，下列各项个人所得，应纳个人所得税：工资、薪金所得;第三条个人所得税的税率：工资、薪金所得，适用超额累进税率，税率为百分之三至百分之四十五。第六条规定，应纳税所得额的计算：工资、薪金所得，以每月收入额减除费用三千五百元后的余额，为应纳税所得额。《个人所得税法实施条例》第二十五条规定，按照国家规定，单位为个人缴付和个人缴付的基本养老保险费、基本医疗保险费、失业保险费、住房公积金，从纳税义务人的应纳税所得额中扣除。
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法律依据
《中华人民共和国个人所得税法》第二条 下列各项个人所得，应当缴纳个人所得税：(一)工资、薪金所得;(二)劳务报酬所得;(三)稿酬所得;(四)特许权使用费所得;(五)经营所得;(六)利息、股息、红利所得;(七)财产租赁所得;(八)财产转让所得;(九)偶然所得。居民个人取得前款第一项至第四项所得(以下称综合所得)，按纳税年度合并计算个人所得税;非居民个人取得前款第一项至第四项所得，按月或者按次分项计算个人所得税。纳税人取得前款第五项至第九项所得，依照本法规定分别计算个人所得税。
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