空气净化器在采用负离子、静电集尘、光触媒、紫外灯等技术的情况下，会产生臭氧。所以，空气净化器主要危害是产生臭氧对人体造成伤害。
每天吸入6微克的颗粒物，患心脏疾病的风险就会增加4.6%。臭氧浓度增加千万分之一，患病风险就会提高4.4%，尤其是对于男性更加明显。动物试验表明，臭氧毒性的起点浓度为0.3ppm，而人对空气中臭氧可嗅知的浓度为0.02～0.04ppm，根据臭氧对肺功能毒性的试验结果，提出1.5～2.0ppm为臭氧允许浓度的上限。卫生部规定臭氧最高允许浓度为0.3mg/m³(0.15ppm)。臭氧还会破坏人体的免疫机能，诱发淋巴细胞染色体病变，加速衰老， 致使孕妇生畸形儿。臭氧的 半衰期是4~12h不等，臭氧消耗完需要：在26~27℃时 需要：10/1-0.5=20 小时 。