共六人
第一任司令员 萧劲光
第二任司令员 叶飞（任职时间 1980.01-1982.08）
叶飞， 1914年生于菲律宾奎松省一个华侨家庭，1918年归国。1932年到闽东参与创建闽东苏区和游击武装。解放战争时期，历任山东野战军第1纵队司令员，华东野战军第l兵团副司令员兼第1纵队司令员，第三野战军10兵团司令员，福建军区司令员。中华人民共和国成立后，曾任中共福建省委第一书记，福建省省长，南京军区副司令员，福州军区司令员兼政治委员，交通部部长。1980年，任海军司令员。1999年4月18日在北京逝世。
第三任司令员 刘华清（任职时间 1982.08-1988.01）
刘华清，1916年出生，湖北大悟人。1929年参加革命。历任中队长、指导员、科长、干部大队大队长兼政委；八路军129师秘书主任，冀南军区组织部长、军分区政委；旅政委、军政治部主任等职。新中国成立后，历任西南军政大学政治部主任、军副政委、第一海军学校副校长兼副政委、北海舰队副司令员兼旅顺基地司令员、国防部第7研究院院长、第6机械工业部副部长、国防科委副主任、副总参谋长。1982年，出任海军司令员。
第四任司令员张连忠（任职时间 1988.01-1996.11）
张连忠，1931年6月生，山东胶县人。1960年8月入海军潜水艇学校学习，毕业后便一直在海军中任职。1979年入军事学院学习，毕业后先后任海军舰队副参谋长、海军基地司令员、海军副司令员。1988年1月任海军司令员。与他的三位前任相比，张连忠在海军服役时间最长，与水兵雨里来浪里去，深知部队基层的甘苦和海上生活滋味。
第五任司令员石云生（任职时间 1996.11-2003.06）
石云生，1940年1月生，辽宁抚顺人。1958年6月毕业于空军第1航空预备学校。1979年入读海军指挥学院，毕业后历任海军航空兵师长、南海舰队航空兵司令员、海军航空兵部副司令员、海军副司令员。1996年11月，任海军司令员。
第六任司令员张定发任职时间 2003.06-2006.08）
张定发，1943年12月生，上海浦东人。1960年7月因品学兼优被保送入海军潜水艇学校。毕业后，参与了我国核潜艇建设的开创性工作。1980年10月，张定发作为优秀年轻干部进入海军学院合成指挥班学习。1993年1月起，张定发走上舰队领导岗位。2003年6月至2006年8月，张定发同志任海军司令员。2006年12月14日，因病医治无效在北京逝世。
第七任司令员吴胜利（任职时间 2006.08――）
吴胜利，1945年8月生，河北吴桥人。1964年从地方高考入伍进入军队院校学习，毕业后，曾在4艘国产导弹驱逐舰、护卫舰任职，并担任过8年驱逐舰、护卫舰舰舰长。有着40余年的海军工作阅历，在海军各级主要指挥岗位任过职。2004年6月，升任中国人民解放军副总参谋长。2006年8月，出任海军第7任司令员。
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